分子細胞修飾学 斉藤研究室　Molecular and Cellular Modification Saitoh LABORATORY

平成26年度 （2014年4月〜2015年3月）

今年度は少人数でしたので、一人一人の様子が良く分かりました。院生は一人当たりの学会発表数が多くなりましたね。大変でしたが、その分、実力がついたと思います。また。論文も多く書くことができてよかったです。研究の新しい展開も見えてきましたし、少数精鋭は悪くないですね。研究室を離れる方は、研究室での経験を生かして、それぞれの道で思う存分ご活躍ください。

H26年度ラボメンバー
博士研究員　 河田 仁
M1　 中山 智文、桝田 実紗妃、湯浅 映里
4年　三原 佳子、森 健吾、松本 蛍

スケジュール

4月

03/31　ミーティング＋掃除：湯浅、松本
　　　　 花見 at 北キャンパス


04/03-04/11 個別ミーティング期間
04/07 　JC#1　斉藤：中山、桝田、湯浅、松本、三原
　　　　Farber-Katz S.E. et al.,DNA Damage Triggers Golgi Dispersal via DNA-PK and GOLPH3. Cell, Vol156, Issue 3

　　　　Vol156, Issue 3, 413-427, 30 January 2014
　　　　・ランチョンミーティング
04/11 研究室新歓ディナー・焼肉パーティー
04/14　 JC#2　三原 with 中山：桝田、湯浅、森、松本
　　　　Christophorou M.A et al. Citrullination regulates
　　　　pluripotency and histone H1 binding to chromatin.
　　　　Nature. 2014 Mar 6;507(7490):104-8.
　　　　・ランチョンミーティング
04/21　 JC#3　松本 with 桝田：中山、湯浅、三原、森
　　　　Schimmel J. et al. Uncovering SUMOylation Dynamics during Cell-Cycle

　　　　Progression Reveals FoxM1 as a Key Mitotic SUMO Target Protein. Mol
　　　　Mol Cell. 2014 Feb 25. pii: S1097-2765(14)00115-4.
　　　　・ランチョンミーティング
04/28 JC#4　森 with 湯浅
　　　　Lisa M. D Ambrosio and Brigitte D. Lavoie, Pds5 Prevents the
　　　　PolySUMO-Dependent Separation of Sister Chromatids. Current Biology,
　　　　Volume 24, Issue 4, 361-371, 30 January 2014
04/30 研究室キックオフカンファレンス(計画発表会) & PR2　
　　　　桝田、湯浅、中山、三原、松本

5月

05/12 JC#5　中山 with 松本：桝田、湯浅、三原
　　　　Kinase-mediated changes in nucleosome conformation trigger chromatin decondensation via poly(ADP-ribosyl)ation.
　　　　Mol Cell 2014 Mar 6;53(5):831-42. Epub 2014 Feb 6. Colin J Thomas, Elena Kotova, Mark Andrake, Jared Adolf-
　　　　Bryfogle, Robert Glaser, Catherine Regnard, Alexei V Tulin

05/16 Lunch with Dr. Yoshiaki Azuma 東 義明(Associate Professor, Department of Molecular Biosciences, University of
　　　　Kansas,USA
　　　　3限プロゼミat C227　Dr. Yoshiaki Azuma 東 義明 'The role of mitotic SUMOylation on centromeric functions

05/19 JC#6　桝田 with 森：桝田、湯浅、中山、三原、松本
　　　　SUMO chain-induced dimerization activates RNF4. Rojas-Fernandez A, Plechanovova A,
　　　　Hattersley N, Jaffray E, Tatham MH, Hay RT.Mol Cell. 2014 Mar 20;53(6):880-92. doi:
　　　　10.1016/j.molcel.2014.02.031.
05/23 　桝田さんエピ研発表練習：湯浅、三原、松本
05/25-27 第８回日本エピジェネティクス研究会
　　　　(伊藤国際学術研究センター・東京大学・本郷キャンパス)
　　　　Hattersley N, Jaffray E, Tatham MH, Hay RT.Mol Cell. 2014 Mar 20;53(6):880-92. doi:
　　　　P-45 「能動的脱メチル化に関わる塩基除去修復酵素TDGの細胞内における安定性と局在
　　　　性制御の解析」桝田美紗妃、森山大志、斉藤寿仁
05/26 ミーティング＋掃除：中山、三原、松本

6月

06/02 JC#7　M1：湯浅 with 三原：桝田、中山、森、松本
　　　　Science. 2014 Apr 11;344(6180):189-93. doi: 10.1126/science.1248024. Epub 2014 Mar 20. Mitosis inhibits
　　　　DNA double-strand break repair to guard against telomere fusions.
　　　　Orthwein A1, Fradet-Turcotte A, Noordermeer SM, Canny MD, Brun CM, Strecker J, Escribano-Diaz C, Durocher D.
06/02 エピ研報告会 by 桝田：湯浅、中山、三原、森、松本
06/09 PR2　　中山：桝田、湯浅、三原、松本
06/13 PR2　　湯浅、桝田：中山、三原、松本
06/16 ミーティング＋掃除：桝田、三原、森、松本
06/23 SC#2　松本：桝田、中山、湯浅、森、三原 +ミーティング＋掃除
　　　　Oxidative stress-induced assembly of PML nuclear bodies controls sumoylation of partner proteins.
　　　　Sahin U, Ferhi O, Jeanne M, Benhenda S, Berthier C, Jollivet F, Niwa-Kawakita M, Faklaris O, Setterblad N, de
　　　　The H, Lallemand-Breitenbach V. J Cell Biol. 2014 Mar 17;204(6):931-45. doi: 10.1083/jcb.201305148.
06/30 ミーティング＋掃除

7月

07/01 SC#3　森 ：桝田、中山、湯浅、三原、松本　+ミーティング＋掃除
　　　　The ROS/SUMO Axis Contributes to the Response of Acute Myeloid Leukemia Cells to Chemotherapeutic Drugs.
　　　　Bossis G, Sarry JE, Kifagi C, Ristic M, Saland E, Vergez F, Salem T, Boutzen H, Baik H, Brockly F, Pelegrin M,
　　　　Kaoma T, Vallar L, Recher C, Manenti S, Piechaczyk M. Cell Rep. 2014 Jun 26;7(6):1815-23. doi:
　　　　10.1016/j.celrep.2014.05.016.
07/03(木)-05(土)「クロマチン動構造班会議」北海道サホロリゾート：斉藤、桝田、湯浅

07/07 PR2 4年生：三原、松本＋「クロマチン動構造班会議」報告会：斉藤、桝田、湯浅　
　　　　+ミーティング＋掃除：中山、三原、森、松本
07/14 SC#7　三原：桝田、湯浅、森、松本
　　　　Nuclear envelope composition determines the ability of neutrophil-type cells
　　　　to passage through micron-scale constrictions. Rowat AC, Jaalouk DE, Zwerger
　　　　M, Ung WL, Eydelnant IA, Olins DE, Olins AL, Herrmann H, Weitz DA,
　　　　Lammerding J. J Biol Chem. 2013 Mar 22;288(12):8610-8. doi:
　　　　10.1074/jbc.M112.441535.

07/22(火) ミーティング＋掃除
07/25 生物環境概論：斉藤担当（5時限目：研究内容と研究室の紹介）資料PDF
07/28 振替SC#1 河田　and Farewell Luncheon（うなぎの蒲焼ランチ）
　　　　CRL4Cdt2 E3 Ubiquitin Ligase and PCNA Cooperate to Degrade Thymine
　　　　Glycosylase in S-phase. Shibata E, Dar A, Dutta A. J Biol Chem. 2014
　　　　Jun 24. pii: jbc.M114.574210. [Epub ahead of print]

8月

08/04 10:00〜 ミーティング＋掃除：中山、桝田、湯浅、三原
08/11 10:00〜 ミーティング＋掃除：湯浅、三原、森
08/18 10:00〜 ミーティング＋掃除：桝田、中山、松本
08/21 大学院入試
08/25 10:00〜 ミーティング＋掃除：桝田、中山、湯浅、三原、松本

9月

09/01 ミーティング＋掃除：桝田、湯浅、三原、松本
09/02-03 Dr. Erika Matunis, Professor
　　　　　　　The Johns Hopkins Univ, School of Medicine, Baltimore, USA
09/03 Informal seminar and Sightseeing
09/08 10:00〜ミーティング＋掃除　中山、三原
09/16 10:00〜ミーティング＋掃除
　　　　　　　　　中山、桝田、湯浅、森、松本
09/22 ミーティング＋掃除：中山、桝田、湯浅、三原、松本
9/24-26 西谷秀男先生（兵庫県立大学・教授）の生物環境特別講義E
「染色体複製の細胞周期制御：一度だけ複製する分子機構」
09/24 西谷先生歓迎会 at C216「熊本風お好み焼きパーティー」
09/26 西谷先生プロゼミ
「染色体の再複製を抑制する機構：DNA複製と共役して機能するタンパク質分解による制御」

09/29 後期JC#1 SC 中山：桝田、湯浅、三原、森、松本
A myeloperoxidase-containing complex regulates neutrophil elastase release and actin dynamics during NETosis. Metzler KD, Goosmann C, Lubojemska A, Zychlinsky A, Papayannopoulos V. Cell Rep. 2014 Aug 7;8(3):883-96. doi: 10.1016/j.celrep.2014.06.044. Epub 2014 Jul 24
09/30（火）PR2 全員（夏休みまでの研究の進展と後期の計画＋生化学会発表練習会）

10月

10/06 JC 松本 with 湯浅：中山、桝田、三原、森
　　　　SUMOylation of Psmd1 controls Adrm1 interaction
　　　　with the proteasome.Ryu H, Gygi SP, Azuma Y,
　　　　Arnaoutov A, Dasso M. Cell Rep. 2014 Jun 26;7(6):1842-8.
　　　　doi: 10.1016/j.celrep.2014.05.009. Epub 2014 Jun 5.
10/14 ミーティング＋掃除：桝田、中山、三原、松本

10/15(水)-18(土) 第87回日本生化学会（京都国際会館）
　　　　○湯浅映里、浦野健、斉藤寿仁：トポイソメラーゼ阻害剤に
　　　　よるM期染色体の損傷応答とsumo依存的ubiquitinリガーゼ
　　　　RNF4に関する研究（2P-317）
　　　　○中山智文, 河田仁, 斉藤寿仁：ヒト白血病細胞株HL-60細
　　　　胞を用いたNET/ETs類似の細胞外クロマチン構造体につい
　　　　ての研究（2P-318）
　　　　○山田 紘司、桝田実紗妃、松本蛍、斉藤 寿仁：SUMO修飾
　　　　環境をドミナントに攪乱するSUMO変異体の作製および機能
　　　　解析（2P-320）
10/20 JC 三原 with 中山：桝田、湯浅、松本
　　　　Redox modification of nuclear actin by MICAL-2 regulates
　　　　SRF signaling. Lundquist MR, Storaska AJ, Liu TC, Larsen
　　　　SD, Evans T, Neubig RR, Jaffrey SR. Cell. 2014 Jan 30;156
　　　　(3):563-76. doi:10.1016/j.cell.2013.12.035. Epub 2014 Jan 16.
10/20 生化学会報告会（中山、湯浅、斉藤）＋ミーティング＋掃除
10/27 SC 桝田：中山、湯浅、三原、森、松本＋ミーティング＋掃除
The ADP-ribosyltransferase PARP10/ARTD10 interacts with proliferating cell nuclear antigen (PCNA) and is required for DNA damage tolerance. Nicolae CM1, Aho ER, Vlahos AH, Choe KN, De S, Karras GI, Moldovan GL. J Biol Chem. 2014 May 9;289(19):13627-37. doi: 10.1074/jbc.M114.556340. Epub 2014 Apr 2.

11月

11/04 ミーティング＋掃除（桝田、松本、三原、森）
11/06 PR2 4年生　松本、三原、森：桝田、中山
11/10 JC　湯浅 with 松本：桝田、中山、三原、森
TDP2 protects transcription from abortive topoisomerase activity and is required for normal neural function. Gomez-Herreros F, Schuurs-Hoeijmakers JH, McCormack M, Greally MT, Rulten S, Romero-Granados R, Counihan TJ, Chaila E, Conroy J, Ennis S, Delanty N, Cortes-Ledesma F, de Brouwer AP, Cavalleri GL, El-Khamisy SF, de Vries BB, Caldecott KW. Nat Genet. 2014 May;46(5):516-21. doi: 10.1038/ng.2929. Epub 2014 Mar 23.
11/11-13 学生実習3年（前半）
11/17 JC 森 with 桝田：中山、湯浅、松本、三原
Invertebrate extracellular phagocyte traps show that chromatin is an ancient defence weapon. Robb CT, Dyrynda EA, Gray RD, Rossi AG, Smith VJ. Nat Commun. 2014 Aug 13;5:4627. doi: 10.1038/ncomms5627.
11/17 クリスマスツリー組み立て＋点灯開始
11/18-20 学生実習3年（後半）

11/21 カレーランチョンat C216
11/25(火)-27(木)第37回日本分子生物学会(パシフィコ横浜)　桝田、中山、湯浅、三原、
・湯浅映里、斉藤寿仁「ヒストンシャペロンCAF1-p150を過剰発現する細胞においてSUMO-2/3とユビキチンリガーゼRNF4はS期に複製領域に集積する」
・湯浅映里、斉藤寿仁「SUMO依存型ユビキチンリガーゼRNF4とトポイソメラーゼ反応阻害によるM期染色体の損傷応答に関する研究」
・桝田実紗妃、斉藤寿仁「SUMOとユビキチン修飾による塩基除去修復および能動的DNA脱メチル化制御因TDGの細胞内の局在と安定性の制御」
・中山智文、三原佳子、斉藤寿仁「ヒト白血病細胞株HL-60の細胞外クロマチン誘導系を用いたNeutrophil Extracellular Traps (NETs)の制御期序の解析」
・三原佳子、中山智文、斉藤寿仁「新しい浮遊細胞の固定法を用いたヒト白血病細胞株HL-60の核の分葉化の制御に関する研究

12月

12/01 SC　斉藤＋ミーティング＋掃除：桝田、中山、湯浅、三原、松本
　　　　The AAA-ATPase molecular chaperone Cdc48/p97 disassembles sumoylated centromeres, decondenses
　　　　heterochromatin, and activates ribosomal RNA genes. Merai Z, Chumak N, Garcia-Aguilar M, Hsieh TF, Nishimura T,
　　　　Schoft VK, Bindics J, Slusarz L, Arnoux S, Opravil S, Mechtler K, Zilberman D, Fischer RL, Tamaru H. Proc Natl
　　　　Acad Sci U S A. 2014 Nov 11;111(45):16166-71. doi:
　　　　SRF signaling. Lundquist MR, Storaska AJ, Liu TC, Larsen
　　　　SD, Evans T, Neubig RR, Jaffrey SR. Cell. 2014 Jan 30;156
　　　　10.1073/pnas.1418564111. Epub 2014 Oct 24.
12/03 分子生物学会報告会　桝田、中山、湯浅、三原：松本、森
12/04 M1 プロゼミ予行　桝田、中山、湯浅：三原、松本
12/08 ミーティング＋掃除：桝田、中山、湯浅、三原、松本、森
12/09 新3年生メンバーのランチョン歓迎会 at C216
12/09 SC 湯浅：桝田、中山、三原：松本、森、塚本、魚住、黒田、古橋、山口
　　　　Polyubiquitylation drives replisome disassembly at the termination of DNA replication. Moreno SP, Bailey R,
　　　　Campion N, Herron S, Gambus A. Science. 2014 Oct 24;346(6208):477-81.
12/11 PR2 4年生　三原、松本、森；桝田、中山、湯浅、魚住、黒田、古橋、山口

12/15(月)-17(水) 染色体ワークショップ・核ダイナミクス研究会(広島県宮島安芸グランドホテル) 中山・斉藤
12/16 掃除　桝田、湯浅、三原、松本、森、塚本、魚住、黒田、古橋、山口

12/18 JC 桝田 with 三原
　　　　Chromatin decondensation is sufficient to alter nuclear
　　　　organization in embryonic stem cells. Therizols P, Illingworth
　　　　RS, Courilleau C, Boyle S, Wood AJ, Bickmore WA. Science.
　　　　2014 Dec 5;346(6214):1238-42. doi:
　　　　10.1126/science.1259587
12/18 ワークショップ報告会　中山・斉藤
12/22 忘年会 at 月○（つきまる）
12/23 Dr. Pederson夫妻が来熊・市内観光
12/24 CREST「定量的エピゲノム解析法の開発と細胞分化機構
　　　　の解明」研究会2014 at 東北大学医学部
12/26 大掃除：桝田、湯浅、中山、三原、松本、森、塚本、魚住、黒田、古橋、山口
12/26 MakotoYoshida 吉田 誠 (University of Kansas, USA) セミナー
　　　　"SUMOylated DNA Topoisomerase II Regulates Phosphorylated
　　　　Histone H3 Kinase Haspin at the Centromere." 桝田、湯浅、中山、三原、松本、森、塚本、魚住、黒田、古橋、山口/
　　　　ランチョン at フォリコ：湯浅、中山、三原、松本、森

1月

01/07 初詣（藤崎八幡宮）
01/13 JC 斉藤 +ミーティング＋掃除：桝田、湯浅、中山、三原、松本、森、塚本、魚住、黒田、古橋、山口
　　　　Nuclear translation visualized by ribosome-bound nascent chain puromycylation. David A, Dolan BP, Hickman HD,
　　　　Knowlton JJ, Clavarino G, Pierre P, Bennink JR, Yewdell JW. J Cell Biol. 2012 Apr 2;197(1):45-57.
　　　　doi: 10.1083/jcb.201112145.

01/19 SUMO研究会の予行（松本＋斉藤）＋掃除＋ミーティング：湯浅、中山、三原、松本、森、塚本、魚住、黒田、古橋、山口
01/20 1:00- JC 中山 with 森：桝田、湯浅、三原、松本、塚本、魚住、黒田、古橋、山口
　　　　The SLX4 Complex Is a SUMO E3 Ligase that Impacts on Replication Stress Outcome and Genome Stability.
　　　　Guervilly JH, Takedachi A, Naim V, Scaglione S, Chawhan C, Lovera Y, Despras E, Kuraoka I, Kannouche P, Rosselli F,
　　　　Gaillard PH. Mol Cell. 2015 Ja 8;57(1):123-37. doi: 10.1016/j.molcel.2014.11.014. Epub 2014 Dec 18.
01/23−24：第12回sumo研究会（関西学院大学梅田キャンパス・大阪）松本・斉藤
01/26 卒論提出（研究室内締め切り＋研究室内査読の開始）
01/27 sumo研究会報告会＋ランチョン＋掃除＋ミーティング：桝田、中山、湯浅、松本、森、魚住、黒田、古橋、山口
01/27 PR2 M1桝田、湯浅、中山: 松本、森、魚住、黒田、古橋、山口

2月

01/07 02/03掃除＋ミーティング+ランチョン（ビーフカレーと高級スクランブルエッグ）＋節分豆まき
桝田、中山、湯浅、松本、三原、魚住、黒田、古橋

02/06 卒研発表予行（研究室内）松本、森、三原：桝田、湯浅、中山、古橋、黒田、魚住卒論の提出締め切り
02/10 掃除＋ミーティング：桝田、湯浅、中山、松本、森、三原、古橋、黒田、魚住、山口
02/10 ランチョン（ドリア4つの風味）

02/12-13 卒論発表会
・「タンパク質分解と転写あるいは翻訳の同時抑制によるSUMO−ユビキチン凝集体の誘導：新規のタンパク質品質管理による細胞機能の制御」松本蛍
・「ヒト前骨髄球性白血病細胞HL-60を用いた細胞外トラップ様構造体の生化学および細胞生物学的な解析」森健吾
・「ヒト前骨髄球性白血病細胞HL-60の分化誘導に伴う分葉核形成の分子制御：ActinとSUMO修飾系に着目した解析」三原佳子
02/16 SC 斉藤：桝田、湯浅、中山、松本、森、三原、古橋、黒田、魚住、山口＋掃除＋ミーティング
　　　　The SENP7 SUMO-Protease Presents a Module of Two HP1 Interaction Motifs that Locks HP1
　　　　Protein at Pericentric Heterochromatin. Romeo K, Louault Y, Cantaloube S, Loiodice I, Almouzni G, Quivy JP.
　　　　Cell Rep. 2015 Feb 4. doi: 10.1016/j.celrep.2015.01.004.
02/19-20 修士論文発表会 at D201
02/20 生物学コース主催の歓送会 at くすのき会館+研究室追いコン at かごめ家
　　　　＊三原さんの研究発表がベストプレゼンに選ばれました！三原さんおめでとう！がんばりました！

02/23 PR2 M1+3年生＋掃除＋ミーティング：中山、湯浅、魚住、塚本、古橋、山口

3月

03/02 SC古橋：＋掃除＋ミーティング：湯浅、桝田、黒田、
　　　　　 山口
　　　　The broken MLL gene is frequently located outside the
　　　　inherent chromosome territory in human lymphoid cells
　　　　treated with DNA topoisomerase II poison etoposide.
　　　　Glukhov SI, Rubtsov MA, Alexeyevsky DA, Alexeevski
　　　　AV, Razin SV, Iarovaia OV.PLoS One. 2013 Sep
　　　　25;8(9): e75871. doi: 10.1371/journal.pone.0075871.
　　　　eCollection 2013
03/09 SC塚本：桝田、湯浅、黒田、魚住

　　　　Small ubiquitin-related modifier-1 modification regulates all-trans-retinoic
　　　　acid-induced Small ubiquitin-related modifier-1 modification regulates
　　　　all-trans-retinoic acid-induced differentiation via stabilization of retinoic
　　　　acid receptor α.　Zhou Q, Zhang L, Chen Z,
　　　　Zhao P, Ma Y, Yang B, He Q, Ying M.　FEBS J. 2014 Jul;281(13):3032-47. doi:
　　　　10.1111/febs.12840. Epub 2014 Jun 2.
03/16 SC 黒田：中山、桝田、湯浅、魚住、古橋＋掃除＋ミーティング
　　　　A cotranslational ubiquitination pathway for quality control of misfolded proteins.
　　　　Wang F, Durfee LA, Huibregtse JM.　Mol Cell. 2013 May 9;50(3):368-78.
　　　　doi: 10.1016/j.molcel.2013.03.009. Epub 2013 Apr 11.
03/23 SC 山口：黒田、塚本、古橋＋掃除＋ミーティング
　　　　Small ubiquitin-like modifier (SUMO) isoforms and conjugation-independent function in DNA double-strand break
　　　　repair pathways.　Hu Y, Parvin JD.　J Biol Chem. 2014 Aug 1;289(31):21289-95. doi: 10.1074/jbc.C114.582122. Epub
　　　　2014 Jun 25.
03/25 卒業式
　　　　生物コース代表として三原佳子さんが学位記を受領しました！

03/30 SC 魚住：中山・湯浅・古橋・山口＋掃除＋ミーティング
　　　　　Baboo S, Bhushan B, Jiang H, Grovenor CR, Pierre P, Davis BG, Cook PR.　PLoS One. 2014 Jun 9;9(6):e99346.
　　　　　doi: 10.1371/journal.pone.0099346. eCollection 2014.
　　　　　お花見･スイカ・サンドイッチ　ピクニック in 北キャンパス