分子細胞修飾学 斉藤研究室 Molecular and Cellular Modification Saitoh LABORATORY

令和2年度(2020年4月〜2021年3月)

4月から例年通りのつもりでしたが、新型コロナの影響で3密を避けた生活スタイルの導入、JCやミーティングのオンライン化など、例年とは違った新学期のスタートとなりました。ただ、デジタル世代の皆さんはオンラインへの適応に問題はなかったようで、研究室で3密を避けながらこれまで通りに実験を上手くこなしていました。今年度はコース長だったこともあり、実験指導が十分にできるかどうか心配しましたが、皆さんがコロナ禍の中での研究生活にしっかり対応できたおかげで無事に4年生4名が3月に卒業、修士3名が修了しました。来年度もウイズコロナ体制で進むことになると思いますが12月から加わった3年生3名、3月から加わったJRF1名の新メンバーと共に新たな研究に挑戦して、新時代を切り拓いていくつもりです。

R02年度ラボメンバー
教員 斉藤 寿仁 (教授)
大学院博士課程後期2年 岡田 咲耶(特別研究員DC1)
大学院博士課程前期2年 小林 桃子・深井 裕太・宮崎 航平
大学院博士課程前期1年 有村 悠・馬締 竜平
卒研生 4年 木佐貫 玲央・大塚 碧・渡部 一輝・伊達 日向
JRF 2年 宮川 玲花

スケジュール

3月

03/29 9:30〜ミーティング+掃除:岡田、有村、渡部、伊達、出口、宮川
+お花見ランチョン at 理1号棟

令和2年度(2020年)4月

04/03(金) 9:30〜 研究室ガイダンス
04/04 入学式(新型コロナウイルス対策の一環として中止)
04/06 JC#1 木佐貫 at C226(〜4/3迄に一度事前打ち合わせしましょう):岡田、小林、深井、宮崎、有村、馬締、大塚、渡部、伊達、出口、宮川
Kneissing M. et al. Micronuclei-based model system reveals functional consequences of chromothripsis in human cells. eLife 2019; 8:e50292
04/08 学部1年生(9:00〜)ガイダンス
04/09 学部2年生(1/3組9:30〜, 2/4組11:00〜)ガイダンス
04/09 大学院ガイダンス(15:00〜)
04/13 JC#2 大塚 at C226(〜4/10迄に一度事前打ち合わせしましょう):岡田、小林、宮崎、有村、馬締、木佐貫、渡部、伊達、出口、宮川
Klosin A. et al. phase separation provides a mechanism to reduce noise in cells. Science 367, 464-468 (2020)
04/20 JC#3 at C226 渡部(〜4/17迄に一度事前打ち合わせしましょう):岡田、小林、深井、宮崎、有村、馬締、木佐貫、大塚、伊達、出口、宮川
Wu S. et al. Circular ecDNA promotes accessible chromatin and high oncogene expression. Nature 575, 699-703 (2019)

04/21(火) 授業開始(大学院のみ:オンライン)
04/27 斉藤研キックオフシンポジウム at C226:岡田、宮崎、深井、小林、有村、馬締
+大塚、渡部、伊達、出口、宮川:ミーティング+掃除
04/28 斉藤研キックオフシンポジウムat C226:4年生+JRF 宮川、出口、木佐貫、大塚、渡部、伊達+岡田、宮崎、深井、有村、馬締:ミーティング
*熊大では〜05/22まで、研究室へは自主登校のため、なかなか全員がそろうことがありませんが、右の写真はコロナ禍の中での全員集合の写真です!

5月

05/07 学部・前学期(第1ターム)授業開始(オンライン)
05/11 JC#4伊達:Zoom岡田、小林、深井、宮崎、有村、馬締、木佐貫、大塚、渡部、出口、宮川
Biran A et al. Quantitative identification of senescent cells in aging and disease. Aging Cell (2017) 16, 661-671.
5/12-14+05/19-21 学生実習(TA: 小林、深井、宮崎、有村、馬締+岡田)
⇒7/14-23に変更

05/18 JC#5有村:Zoom岡田、小林、深井、宮崎、馬締、木佐貫、大塚、渡部、伊達、出口、宮川
Gallego LD et al. Phase separation directs ubiquitination of gene-body nucleosomes. Nature 579 (2020)
スイカ割
05/23 研究室への自主登校解除
05/25 PR2 at C226 from 8:40 am~ 岡田、宮崎、深井、小林、有村、馬締+大塚、渡部、伊達、出口、宮川:ミーティング+掃除
05/26 PR2 at C226 from 13:00 pm~宮川、出口、木佐貫、大塚、渡部、伊達+岡田、宮崎、深井、有村、馬締:ミーティング

6月

06/01 Mahamid J et al. Liquid-crystalline phase transitions in liquid droplets are related to cellular states and specific organelle association. Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 116, 16866-16871 (2019)
06/08 JC#7 岡田:宮崎、深井、小林、有村、馬締、大塚、伊達、出口、宮川+:ミーティング+掃除
Keller MD. et al. Decoy exosomes provide protection against bacterial toxins. Nature 579 (2020)
06/15 JC#8 出口:岡田、宮崎、小林、有村、馬締、大塚、木佐貫、伊達、渡部、宮川+ミーティング+掃除
N. Yamada et al. Discovery of a kleptoplastic 'dinotom' dinoflagellate and the unique nuclear dynamics of converting kleptoplastides to permanent plastids. Scientific Rep. 9: 10474 (2019)
06/22 JC#9 小林:岡田、宮崎、深井、小林、有村、馬締、大塚、木佐貫、伊達、渡部、出口、宮川+ミーティング+掃除
S. Yasuda et al. stress- and ubiquitylation-dependent phase separation of proteasome. Nature 578 296-300 (2020)
06/29 PR2岡田、宮崎、深井、有村、馬締、宮川(大塚、木佐貫、伊達、渡部)+ミーティング+掃除
06/30 PR2大塚、木佐貫、伊達、渡部、小林(岡田、宮崎、深井、有村、馬締、宮川)

7月

07/02 前学期(第2ターム)開始
07/06 JC#10 深井:岡田、宮崎、小林、有村、馬締、大塚、木佐貫、伊達、渡部、宮川+ミーティング+掃除
M. Simunovic et al. Friction mediates scission of tubular membranes scaffolded by BAR proteins. Cell 170, 172-184 (2017)
07/13 JC#11 宮崎:岡田、小林、深井、有村、馬締、大塚、木佐貫、伊達、渡部、宮川+ミーティング+掃除
M. Nava et al. Heterochromatin-driven nuclear softening protects the genome against mechanical stress-induced damage. Cell 181, 800-817 (2020)
07/14-16+
07/21-23
学生実習(TA: 小林、深井、宮崎、有村、馬締+岡田)

07/20 JC斉藤「ゲノムサイエンスの発展とコロナウイルスの分子生物学」
岡田、宮崎、小林、深井、有村、馬締、木佐貫、伊達、渡部、宮川+ミーティング+掃除
07/23 土用の丑の日ディナーat C216

07/29 日 PR2
8:40~9:00、質疑応答9:00~9:10
木佐貫 玲央「微小核構造の多様性と細胞応答の均一性:核輸送制御の破綻と細胞運命決定の関連性」
9:10~9:30、質疑応答9:30~9:40
大塚 碧「ポリアミンを用いたDNAおよび核構造の動的制御と細胞機能操作」
9:40~10:00、質疑応答10:00~10:10
渡部 一輝「染色体外環状DNA形成の分子制御とその生理的意義に関する研究」
10:10~10:30、質疑応答10:30~10:40
伊達 日向「細胞サイズと細胞老化に関わる環境ストレスの探索」
10:40~11:15、質疑応答11:15~11:30
岡田 咲耶「・Preconditioning of recipient cells by glycosylation agents promotes cellular uptake of constituents in giant extracellular vesicles.・Co-incubation of spinach chloroplasts with HeLa human cervical cells indicates potential application of the plant cell organelle as a biocompatible vector in cultured human cells」
休息11:30~12:55
12:55~13:15、質疑応答13:15~13:25
馬締 竜平「有糸分裂期におけるオレイン酸添加による脂肪滴の誘導と染色体分配への影響」
キャンセル⇒延期
13:25~13:45、質疑応答13:45~13:55
有村 悠「G4オリゴDNAのin vitroにおける液相分離と細胞内導入に伴う核構造変化」
13:55~14:15、質疑応答14:15~14:25
小林 桃子「核内におけるアミロイド蓄積の検出と制御基盤及び生理的意義に関する研究」
キャンセル⇒延期
14:25~14:45、質疑応答14:45~14:5513:55~14:15、質疑応答14:15~14:25
深井 裕太「化学的操作による大型細胞外ベシクルの形成とその構造と機能に関する研究」
14:55~15:15、質疑応答15:15~15:2514:25~14:45、
質疑応答14:45~14:55
宮崎 航平「微小核誘導系の確立と微小核の融合の分子制御に関する研究」
14:45~16:00 Meeting & 掃除
16:30~17:30
16:00~17:00 Beer and Chips Party at C216

8月

*8月中のJCはお休みの予定です
(meeting+clean-upは継続予定)

08/21 プロゼミ(金) D2岡田+M2(小林、深井、宮崎)⇒9/24に変更
08/22-23 大学院自然科学研究部 入学試験

9月

〜09/04 前学期(第2ターム)終了
09/06〜07 大型台風10号の九州通過!
9/08 台風通過後、研究室リトリート・グリーンランドに行ってきました!
9/23 プロゼミ予行13:00~14:00 at C227(Drは20分English、M2の学生は10分English or Japanese)
9/24 プロゼミM2 小林、深井、宮崎 at 大教センターE305
9/25 プロゼミDr. 岡田at 大教センターE305
9/28 R02年度後期の開始

9/28 午前9:00~ meeing at C204+clean-up:小林、深井、有村、馬締、大塚、木佐貫、伊達、渡部
B. Guey et al. BAF restricts cGAS on nuclear DNA to prevent innate immune activation. Science 369, 823-828 (2020)
9/30 小林、深井、宮崎、有村、馬締、大塚、木佐貫、伊達、渡部、宮川
16:00~17:00 じゃがりこ&ワインパーティー at C216

*9月1-3週はJC、PR2はお休みします
(不定期でmeeting+clean-upは行います)

10月

10/05 午前9:00~ meeting at C204+clean-up:岡田、小林、深井、宮崎、有村、馬締、大塚、伊達、渡部
10/06 大塚:岡田、深井、宮崎、有村、馬締、木佐貫、伊達、渡部、宮川
M. Du et al. DNA-induced liquid phase condensation of cGAS activates innate immune signaling. Science 361, 704-709 (2018)
10/12 午前9:00~ meeting at C204+clean-up:岡田、小林、深井、宮崎、有村、馬締、大塚、伊達、木佐貫、渡部
10/13 渡部:岡田、小林、深井、宮崎、有村、馬締、大塚、伊達、木佐貫、宮川
Y. Zhu et al. NP220 mediates silencing of unintegrated retroviral DNA. Nature 564, 278-282 (2018)
10/19 午前9:00~ meeting at C204+clean-up:岡田、小林、深井、宮崎、有村、馬締、大塚、伊達、木佐貫、渡部
10/16 3年生に対する研究室紹介
10/20 伊達:岡田、小林、深井、宮崎、有村、馬締、大塚、木佐貫、渡部、宮川
E. Zatulovskiy et al. Cell growth dilutes the cell cycle inhibitor Rb to trigger cell division. Science 369, 466-471 (2020)
10/26 午前9:00~ meeting at C204+clean-up: 深井、宮崎、有村、馬締、大塚、木佐貫、渡部、伊達
10/26-27 第7回日本細胞外小胞学会:岡田 *ポスター発表で受賞しました!おめでとう!!
10/28 PR2第1日目有村、小林、宮川、伊達、宮崎:岡田、深井、馬締、大塚、木佐貫、渡部
+秋フルーツとお芋deピクニック at 白川河川敷

10/29 PR2第2日目大塚、馬締、木佐貫、深井、渡部、岡田+学会報告会(岡田): 有村、小林、宮川、伊達、宮崎

11月

11/03 祝日のためJCはお休み
11/04 午前9:00~ meeting at C204+clean-up: 岡田、深井、宮崎、有村、馬締、大塚、木佐貫、渡部、伊達、宮川
11/09 午前9:00~ meeting at C204+clean-up:岡田、深井、小林、宮崎、有村、馬締、大塚、渡部、伊達、木佐貫
11/10 宮崎:岡田、深井、小林、有村、馬締、大塚、渡部、伊達、木佐貫、宮川
G. Dey et al. Closed mitosis requires local disassembly of the nuclear envelope. Nature 585, 119-123 (2020)
11/10-11 研究室204/205/215/216号室の床掃除?ピカピカになりました!机の配置を大きく変えました!
11/16 午前9:00~ meeting at C204+clean-up:岡田、深井、宮崎、小林、有村、馬締、大塚、渡部、伊達

11/17 深井:岡田、宮崎、小林、有村、馬締、大塚、渡部、伊達、宮川
A. Pfitzner et al. An ESCRT-III polymerization sequence drives membrane deformation and fission. Cell 182, 1140-1155 (2020)
11/19 クリスマスツリーの組み立てとデコレーション開始
11/24 午前9:00~ meeting at C204+clean-up:岡田、宮崎、有村、馬締、大塚、木佐貫、渡部、伊達、宮川
11/24 小林:岡田、宮崎、深井、有村、馬締、大塚、木佐貫、渡部、伊達、宮川

  T. Rayon et al. Species-specific pace of development is associated with differences in protein stability. Science 369, 1449 (2020)
11/25 PR2(午前はZoom)宮崎、小林、有村、馬締、大塚、岡田、深井
(午後は対面at C227)木佐貫、渡部、伊達
11/29 8:00 am~16:00 pm南キャンパス停電+断水
11/30 午前9:00~ meeting at C204+clean-up +3年生新メンバー(3名)顔合わせ:岡田、小林、深井、宮崎、有村、馬締、大塚、木佐貫、渡部、伊達、磯部、小川、山ア

12月

*3年生新メンバー(3名)が研究活動と研究室の活動に加わります!

12/01 2限目学会発表予行(岡田、宮崎)zoom:岡田、宮崎、小林、深井、有村、馬締、大塚、磯部、小川、山ア
12/02-04 分子生物学会(オンライン)岡田、宮崎
12/05-09 ASCB meeting 米国細胞生物学会(岡田)
12/07 午前9:00~ Zoom meeting「研究のまとめ方:卒論の書き方」by 斉藤:岡田、宮崎、小林、深井、有村、馬締、大塚、木佐貫、渡部、伊達、磯部、小川、山ア
12/08 学会報告会 by 岡田・宮崎+プロゼミ予行(有村、馬締)at C330+clean-up
12/12 プロゼミM1(有村、馬締)at 百周年記念会館

12/14 午前9:00~ meeting at C204+clean-up:岡田、宮崎、深井、小林、有村、馬締、大塚、木佐貫、伊達
12/15 岡田:宮崎、深井、小林、有村、馬締、大塚、伊達、木佐貫、渡部、磯部、小川、山ア、宮川A. Bisaria et al. Membrane-proximal F-actin restricts local membrane protrusions and directs cell migration. Science 368, 1205-1210 (2020)12/16 1:00 am~1:45 am 岡田さんASCB/EMBO meeting でzoomによるポスター発表
12/21 午前9:00~ meeting at C204+clean-up:岡田、宮崎、深井、有村、馬締、大塚、木佐貫、伊達、小川、山ア
12/24 PR2 *実質的には12月のPR2までの結果で卒研あるいは修論をまとめます。岡田、宮崎、深井、小林、有村、馬締、大塚、木佐貫、伊達、磯部、小川、山ア、宮川クリスマスケーキパティ― at C216

2021年1月

01/12 午前9:00~ meeting at C204+clean-up+JC変更〜有村:岡田、宮崎、深井、小林、馬締、大塚、木佐貫、伊達、渡部、小川、山ア、磯部
S Cuylen-Haering et al. Chromosome clustering by Ki-67 excludes cytoplasm during nuclear assembly. Nature 587, 285-290 (2020)
01/12 お昼12:00~ 有志による藤崎八幡宮への初詣:小川、山ア、磯部
01/18 午前9:00~ meeting at C204+clean-up
01/19 JC馬締:岡田、宮崎、深井、有村、大塚、木佐貫、伊達、渡部、小川、山ア
M Bosch et al. Mammalian lipid droplets are innate immune hubs integrating cell metabolism and host defense. Science 370, 309, eaay8085 (2020)
01/18 卒論&修論の研究室締め切り
01/18-24 卒論&修論の研究室内査読期間⇒24日までに斉藤に査読結果を知らせる
01/25 午前9:00~ meeting at C204+clean-up:岡田、深井、馬締、有村、大塚、木佐貫、伊達、小川、山ア、磯部
01/25 査読結果を著者に知らせる⇒著者は論文に加筆・修正を加えて、提出版を作成・印刷
01/26 3限JRF発表会 at C122大講義室(宮川)
01/27 3~5限PR2 at C227中講義室
*4年生とM2は発表を意識して8分(4年生)、12分(M2)でまとめてください。
*D2, M1, 3年生, JRFの方は、1月に得た最新データを報告してください
01/27 ~17:00(時間厳守)修士論文提出締め切り(1回目)→副指導委員による査読開始
01/29 ~17:00(時間厳守)卒論提出締め切り

2021年2月

02/01 午前9:00~ meeting at
C204+clean-up:岡田、深井、宮ア、
馬締、有村、大塚、木佐貫、伊達、
山ア
~午後5時まで:卒論・修論発表
会用の要旨提出の締め切り
02/03 3限:卒論(8分)研究室
内発表練習会#1 at C227
02/05 3限:修論(12分)研究室
内発表練習会#1 at C329 +4年生
の発表練習会#2(原稿なしで!)
02/08 修論2回目最終版提出期限
02/08 (9:30~15:35) 卒論発表会 ☆
13:10~14:00斉藤研メンバー発表
02/09 (9:30~15:35) 卒論発表会
02/10 (9:30~14:35) 卒論発表会
*その後16:00~ ⇒M2の発表練習
会#2 at C122
02/12 (9:25~15:35) 修論発表会 ☆
13:00~14:00斉藤研メンバー発表
02/15 午前9:00~ meeting at C204+clean-up:岡田、深井、宮ア、馬締、有村、大塚、木佐貫、伊達、山ア、磯部、小川
02/15 卒論・修論の判定会議 宮アさんベストプレゼン賞受賞しました!おめでとう!!
02/22 午前9:00~ meeting at C204+clean-up:岡田、深井、馬締、有村、伊達、渡部、山ア、宮川
02/24 PR2 3〜4限at C226:岡田、深井、宮ア、馬締、有村、木佐貫、伊達、渡部、山ア、磯部、小川、宮
川 茶話会at C216
02/25-26 大学入試(前期試験)

2021年3月

03/12 大学入試(後期試験)
03/22 R3年度JRFに東有里紗さん合格
斉藤研に配属決定。画期的な新発見を期待します!
03/25 卒業式・修了式+学位記授与式 at C226

令和2年度コース長の斉藤から学位記が授与されました!
桜が満開ピークを過ぎて散り始めた中での卒業式でした!


コロナ禍の中、いろいろなことがありました。1年間お疲れさま!卒業・修了おめでとう!