今年度は斉藤が講座主任を務めていたため、例年に比べると皆さんと話す時間が十分取れなかったかもしれません。また、就職活動の期間が大きく変わったこともあって、学生の皆さんにとっての研究活動は例年に比べて大変だったものと思われます。それでも、論文や学会発表など、例年以上に数多くこなせました。これは、ひとえに皆さんのがんばりのおかげです。お疲れ様でした。今後は研究室での経験を生かして、それぞれの持ち場でおおいに活躍してください。期待しています。
4月
03/30 お花見ピクニック in 北キャンパス
(スイカ・サンドイッチ)
04/06 研究室ガイダンス＋ミーティング＋掃除 中山、桝田、
湯浅、魚住、黒田、塚本、本橋、山口
04/13 ミーティング＋掃除：中山、桝田、魚住、黒田
04/15 #1JC 桝田with 魚住：中山、湯浅、黒田、塚本、古橋、
山口
SUMO-2 Orchestrates Chromatin Modifiers in
Response to DNA Damage. Hendriks IA, Treffers LW,
Verlaan-de Vries M, Olsen JV, Vertegaal AC. Cell Rep.
2015 Mar 10. pii: S2211-1247(15)00179-5. doi:
10.1016/j.celrep.2015.02.033.
04/20 ミーティング＋掃除：黒田、魚住、塚本、古橋、山口
04/22 #2JC 中山 with 黒田：湯浅、桝田、魚住、塚本、古橋、山口
The unfolded protein response governs integrity of the haematopoietic stem-cell
pool during stress. van Galen P, Kreso A, Mbong N, Kent DG, Fitzmaurice T,
Chambers JE, Xie S, Laurenti E, Hermans K, Eppert K, Marciniak SJ, Goodall JC,
Green AR, Wouters BG, Wienholds E, Dick JE. Nature. 2014 Jun
12;510(7504):268-72. doi: 10.1038/nature13228. Epub 2014 Apr 28.
04/27 ミーティング＋掃除：中山、湯浅、桝田、黒田、魚住、古橋、山口
04/28 キックオフ＃１（計画発表会）中山、黒田、魚住、塚本、古橋
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5月
05/07-09 クロマチン動構造半会議at 北海道サホロリゾート
05/11 ミーティング＋掃除：桝田、湯浅、中山、魚住、古橋
05/12-14 学生実習（前半）
05/18 ミーティング＋掃除：湯浅、魚住、塚本
05/19-21 学生実習（後半）
05/25 PR2 湯浅、魚住、山口
05/28 #3JC 湯浅 with 塚本：中山、桝田、魚住、山口
Activation of DNA damage response signaling by condensed chromatin. Burgess RC, Burman B, Kruhlak MJ,
Misteli T. Cell Rep. 2014 Dec 11;9(5):1703-17. doi: 10.1016/j.celrep.2014.10.060. Epub 2014 Nov 20.
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6月
06/01 ミーティング＋掃除：中山、湯浅、魚住、古橋、山口
06/03 #4JC 山口 with 湯浅：中山、桝田、魚住、古橋、塚本
Chromosomes Progress to Metaphase in Multiple Discrete Steps via Global Compaction/Expansion Cycles.
Liang Z, Zickler D, Prentiss M, Chang FS, Witz G, Maeshima K, Kleckner N. Cell. 2015 May
21;161(5):1124-37. doi: 10.1016/j.cell.2015.04.030.
06/08 ミーティング＋掃除：湯浅、中山、魚住、古橋、塚本
06/10 #5JC 魚住 with 中山：湯浅、桝田、古橋、塚本、山口
A cellular system that degrades misfolded proteins and
protects against neurodegeneration. Guo L, Giasson BI,
Glavis-Bloom A, Brewer MD, Shorter J, Gitler AD, Yang X.
Mol Cell. 2014 Jul 3;55(1):15-30. doi: 10.1016/j.molcel.2014.04.030.
Epub 2014 May 29.
06/15 ミーティング＋掃除：湯浅、桝田、魚住、古橋
06/17 もろこしの日
06/19 9:30- #6JC 塚本 with 中山
The inhibitory effect of secretory leukocyte protease inhibitor (SLPI) on
formation of neutrophil extracellular traps. Zabieglo K, Majewski P, Majchrzak-Gorecka M, Wlodarczyk A, Grygier B,
Zegar A, Kapinska-Mrowiecka M, Naskalska A, Pyrc K, Dubin A, Wahl SM, Cichy J. J Leukoc Biol. 2015 Apr 27.
pii: jlb.4AB1114-543R. [Epub ahead of print]
06/22 ミーティング＋掃除：湯浅、桝田、魚住、黒田、塚本、古橋、山口
06/24 #7JC 古橋 with 湯浅：魚住、黒田、塚本
Topoisomerase II mediates meiotic crossover interference. Zhang L, Wang S, Yin S, Hong S, Kim KP, Kleckner N.
Nature.2014 Jul 31;511(7511):551-6. doi: 10.1038/nature13442. Epub 2014 Jul 13.
06/29 ミーティング＋掃除：湯浅、桝田、魚住、黒田、古橋、山口
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7月
07/02 PR2：湯浅、桝田、魚住、黒田、塚本、古橋
07/06 ミーティング＋掃除：湯浅、桝田、魚住、黒田、塚本、古橋
07/08 #JC 黒田 with 桝田
Protein polyphosphorylation of lysine residues by inorganic polyphosphate.
Azevedo C, Livermore T, Saiardi A. Mol Cell. 2015 Apr 2;58(1):71-82. doi:
10.1016/j.molcel.2015.02.010. Epub 2015 Mar 12.
07/13 ミーティング＋掃除：湯浅、桝田、黒田、塚本、古橋
07/22 ミーティング＋掃除：桝田、魚住、黒田
07/27 ミーティング＋掃除：中山、魚住、黒田、塚本、古橋
07/28〜7/31 個別PR2：中山、桝田、湯浅、魚住、黒田、古橋
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8月
08/03 ミーティング＋掃除：桝田、魚住、黒田、古橋
08/10 ミーティング＋掃除：桝田、中山、魚住、黒田、古橋
08/13-14 夏季一斉休業
08/17 ミーティング＋掃除：中山、桝田
08/21 M2プロゼミ予行：湯浅、中山：黒田、山口
08/23-26 International Symposium on Chromatin Structure, Dynamics, and Function
Awaji Yumebutai International Conference Center, Awaji, Japan, August 23-26, 2015
ポスター発表＃9：Eri Yuasa, Misaki Masuda and Hisato Saitoh.Characterization of Chromatin Regulators that
Interact with SUMO-2/3: Toward Elucidating Roles of the SUMO Modification Pathway in Epigenetic
Chromatin Regulation.
ポスター発表＃24：Tomofumi Nakayama, Kengo Mori and Hisato Saitoh
Tunicamycin Induces Extracellular Chromatin in Cultured Human Myeloid Cell Lines.
08/27 International Symposium on Nuclear Structure and Epigenetics
IMEG, Kumamoto University, August 27, 2015
08/28-29 M2プロゼミ；中山、湯浅、桝田
08/28-29 ゲノム安定性の機構と生命の維持‐進化・癌化・老化の理解のために
京都大学百周年時計台記念館
08/31 ミーティング＋掃除：中山、湯浅、桝田、古橋
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9月
09/07 ミーティング＋掃除：中山、湯浅、桝田、古橋
09/08-09 生物環境特別講義 B 小布施力史先生（北大・院・先端生命科学研究院・分子細胞生物学研究室・教授：X-染色体の構造と機能）
09/09 プロゼミ「ヘテロクロマチンの構造と機能」
小布施先生歓迎会＆お別れ会BBQ at 中庭
09/14 ミーティング＋掃除：中山、桝田、黒田、古橋
09/28 後期JC#1を開始します！黒田 with 魚住：中山、湯浅、桝田、古橋
Proteotoxic stress reprograms the chromatin landscape of SUMO modification. Seifert A, Schofield P, Barton GJ,
Hay RT. Sci Signal. 2015 Jul 7;8(384):rs7. doi: 10.1126/scisignal.aaa2213
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10月
10/05 ミーティング＋掃除, JC湯浅 with 黒田: 中山、桝田、塚本、古橋、魚住、、山口
Identification of Gene Positioning Factors Using High-Throughput Imaging Mapping. Shachar S, Voss TC, Pegoraro G,
Sciascia N, Misteli T. Cell. 2015 Aug 13;162(4):911-23.
10/13 ミーティング＋掃除, JC 古橋 with 桝田：中山、湯浅、黒田、魚住、山口
EZH2 inhibition sensitizes BRG1 and EGFR mutant lung tumours to TopoII inhibitors. Fillmore CM, Xu C, Desai PT,
Berry JM, Rowbotham SP, Lin YJ, Zhang H, Marquez VE, Hammerman PS, Wong KK, Kim CF. Nature.
2015 Apr 9;520(7546):239-42.
10/19 ミーティング＋掃除, JC 桝田 with 山口: 中山、湯浅、黒田、魚住、塚本、古橋
Transient accumulation of 5-carboxylcytosine indicates involvement of active demethylation in lineage specification
of neural stem cells. Wheldon LM, Abakir A, Ferjentsik Z, Dudnakova T, Strohbuecker S, Christie D, Dai N, Guan S,
Foster JM, Correa IR Jr, Loose M, Dixon JE, Sottile V, Johnson AD, Ruzov A. Cell Rep. 2014 Jun 12;7(5):1353-61
10/23 特別講義：木村暁先生（国立遺伝学研究所）＋ステーキ歓迎会
10/26 ミーティング＋掃除, JC魚住 with湯浅: 中山、桝田、黒田、塚本、古橋、山口
SUMOylation is an inhibitory constraint that regulates the prion-like aggregation and activity of CPEB3. Drisaldi B.
et al. Cell Rep. 2015 June 23; 11, 1694-1702.
10/29 PR2 4年+M2 午前：黒田、桝田、塚本、古橋；午後：中山、湯浅、魚住
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11月
11/02 JC 中山 with 古橋：湯浅、桝田、魚住、黒田、塚本、古橋、山口
Inflammation. Neutrophil extracellular traps license macrophages for cytokine production in atherosclerosis.
Warnatsch A, Ioannou M, Wang Q, Papayannopoulos V. Science. 2015 Jul 17;349(6245):316-20.
doi:10.1126/science.aaa8064.
11/09 掃除＋ミーティング：桝田、湯浅、古橋、魚住
11/16 JC 塚本 with 湯浅
Aggregated neutrophil extracellular traps limit inflammation by degrading cytokines and chemokines. Schauer
C, Janko C, Munoz LE, Zhao Y, Kienhofer D, Frey B, Lell M, Manger B, Rech J, Naschberger E, Holmdahl R,
Krenn V, Harrer T, Jeremic I, Bilyy R, Schett G, Hoffmann M, Herrmann M. Nat Med. 2014 May;20(5):511-7.
11/16 クリスマスツリー飾り付け開始
11/24 Sc黒田：桝田、湯浅、中山、古橋、魚住、塚本
A new vertebrate SUMO enzyme family reveals insights into SUMO-chain assembly. Eisenhardt N, Chaugule
VK, Koidl S, Droescher M, Dogan E, Rettich J, Sutinen P, Imanishi SY, Hofmann K, Palvimo JJ, Pichler A.
Nat Struct Mol Biol. 2015 Nov 2. doi: 10.1038/nsmb.3114.
11/26 PR2+分子生物・生化学会発表予行：中山、桝田、湯浅、黒田、古橋、魚住、塚本
11/30 JC山口 with 中山：桝田、湯浅、黒田、古橋、魚住、塚本
Real-time deformability cytometry: on-the-fly cell mechanical phenotyping. Otto O, Rosendahl P, Mietke A,
Golfier S, Herold C, Klaue D, Girardo S, Pagliara S, Ekpenyong A, Jacobi A, Wobus M, Topfner N, Keyser UF,
Mansfeld J, Fischer-Friedrich E, Guck J. Nat Methods. 2015 Mar;12(3):199-202, 4 p following 202.
doi: 10.1038/nmeth.3281. Epub 2015 Feb 2.
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12月
12/01-04 第38回日本分子生物学界・第88回日本生化学会・合同大会BMB2015（神戸ポートアイランド）
2P0610 「SUMOとユビキチンによる新生ポリペプチド鎖の核内における品質管理の制御」魚住直毅、斉藤寿仁
2P0611「トポイソメラーゼ反応阻害剤によるM期染色体の損傷とSUMO-RNF4-ユビキチン経路の活性化」湯浅映里・
斉藤寿仁
2P0612「SUMOとユビキチン修飾による塩基除去修復因子TDGの細胞内局在と安定性の制御」桝田実紗妃・斉藤寿仁
2P0613「血液細胞分化における核の分葉化と細胞死における細胞外クロマチンの形成」中山智文・三原佳子・
斉藤寿仁
12/07 SC古橋：中山、桝田、湯浅、魚住、塚本、山口
The PML nuclear bodies-associated protein TTRAP regulates ribosome biogenesis in nucleolar cavities
upon proteasome inhibition.
Vilotti S, Biagioli M, Foti R, Dal Ferro M, Lavina ZS, Collavin L, Del Sal G, Zucchelli S, Gustincich S. Cell Death Differ.
2012 Mar;19(3):488-500.
12/07 新メンバー（3年生：H28卒研生）配属
12/14 SC 中山：桝田、湯浅、魚住、黒田、古橋、山口、
袰川、柳井、中間、松尾、飯星
Neutrophils sense microbe size and selectively release
neutrophil extracellular traps in response to large
pathogens. Branzk N, Lubojemska A, Hardison SE,
Wang Q, Gutierrez MG, Brown GD, Papayannopoulos V.
Nat Immunol. 2014 Nov;15(11):1017-25.
doi: 10.1038/ni.2987.
12/17 PR2 桝田、湯浅、山口、袰川、柳井、中間、松尾、
飯星
12/21 ミーティング＋掃除：中山、湯浅、桝田、魚住、（古橋）、山口、袰川、中間、飯星
12/22 SC 桝田：中山、湯浅、黒田、魚住、塚本、古橋、山口、柳井、袰川、中間、松尾、飯星
RING finger protein 4 (RNF4) derepresses gene expression from DNA methylation. Wang Y. J Biol Chem. 2014 Dec
5;289(49):33808-13. doi: 10.1074/jbc.C114.611558. Epub 2014 Oct 29.
SC 湯浅：中山、桝田、黒田、魚住、塚本、古橋、山口、柳井、袰川、中間、松尾、飯星
Ubiquitin-specific Protease 11 (USP11) Deubiquitinates Hybrid Small Ubiquitin-like Modifier (SUMO)-Ubiquitin Chains
to Counteract RING Finger Protein 4 (RNF4). Hendriks IA, Schimmel J, Eifler K, Olsen JV, Vertegaal AC. J Biol Chem.
2015 Jun 19;290(25):15526-37. doi: 10.1074/jbc.M114.618132. Epub 2015 May 12.
12/22 大掃除+忘年会・新メ歓迎会 at くろねこや
12/28 クリスマスツリーの後片付け→仕事納め昼食会（「たこ飯」を食べながら1年を振り返る）
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1月
01/07（木） ミーティン＋SC 斉藤：湯浅、中山、桝田、黒田、魚住、古橋、
山口、柳井、袰川、中間、松尾、飯星
The histone chaperone CAF-1 safeguards somatic cell identity.
Cheloufi S et al. Nature. 2015 Dec 10;528(7581):218-24.
doi: 10.1038/nature15749.
01/07 初詣 藤崎八幡宮
01/12（火） ミーティング＋掃除
01/12-14 染色体WS/核ダイナミクス at 仙台松島
01/18（月） SC：湯浅、桝田、黒田、魚住、古橋、山口、袰川、松尾、飯星、中間
SC 山口 Activated endothelial cells induce neutrophil extracellular traps and are susceptible to NETosis-mediated
cell death. Gupta AK, Joshi MB, Philippova M, Erne P, Hasler P, Hahn S, Resink TJ. FEBS Lett.
2010 Jul 16;584(14):3193-7. doi: 10.1016/j.febslet.2010.06.006. Epub 2010 Jun 10.
SC魚住 Translation. An RNA biosensor for imaging the first round of translation from single cells to living animals.
Halstead JM, Lionnet T, Wilbertz JH, Wippich F, Ephrussi A, Singer RH, Chao JA. Science.
2015 Mar 20;347(6228):1367-671. doi: 10.1126/science.aaa3380.
01/22-23 SUMO研究会（SUMO-XIII）at関西学院大学・大阪梅田キャンパス
01/25 ミーティング＋掃除：桝田、黒田、魚住、古橋、飯星
01/25 研究室内の修士論文締め切り（5:00pm）→研究室内での査読開始
01/28 研究室内の卒論締め切り（5:00pm）→研究室内での査読開始→プレゼンの練習開始
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2月
02/01（月） ミーティング＋掃除：桝田、湯浅、魚住、山口、袰川、松尾、飯星、中間
12時〆切 修論提出1回目
02/03 第2回良い映画を見る会「愛と哀しみのボレロ」
02/04（木） 17時〆切 卒論提出
02/08（月） 9:30-卒研発表会の研究室予行+ミーティング＋掃除
02/12-13（金-土） 卒論発表会 at D201
02/15 ミーティング＋掃除：中山、湯浅、桝田、魚住、古橋、山口、飯星、袰川、飯星、中間
02/15 指導教員提出 修論2回目
02/15 修論発表会の研究室予行
02/18-19（木-金） 修論発表会
02/19 修論評価
02/19（金） 18時〜歓送会 at くすの木会館 ＊魚住直毅君、ベストプレゼン賞受賞! おめでとう！！
9:00- 研究室追いコン at 楽喜
02/22（月） ミーティング＋掃除：山口、袰川、中間、柳井、松尾
02/24 卒研英文アブストラクト提出締め切り
02/29（月） pre-JC柳井：黒田、袰川、中間＋ミーティング＋掃除
Neutrophils sense microbe size and selectively release neutrophil
extracellular traps in response to large pathogens. Branzk N,
Lubojemska A, Hardison SE, Wang Q, Gutierrez MG, Brown GD,
Papayannopoulos V. Nat Immunol. 2014 Nov;15(11):1017-25.
doi: 10.1038/ni.2987. Epub 2014 Sep 14.
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3月
03/07 ミーティング＋掃除：山口、袰川、中間、柳井、飯星
03/14 pre-JC中間 +ミーティング＋掃除
Redefining the Translational Status of 80S Monosomes. Heyer EE, Moore MJ. Cell.
2016 Feb 11;164(4):757-69. doi:10.1016/j.cell.2016.01.003.
03/22 pre-JC袰川: 中間、柳井、飯星、松尾、岡田+ミーティング＋掃除
Redefining the Translational Status of 80S Monosomes. Heyer EE, Moore MJ. Cell. 2016 Feb11;164(4):757-69.
doi:10.1016/j.cell.2016.01.003.
03/22 岡田咲耶さん、Junior Research Fellowに合格！おめでとう！
斉藤研メンバーとして活動開始！
03/25 卒業式
03/25 学業と研究実績が認められ、中山智文君が研究科長表彰を受けました！おめでとう！
03/28 pre-JC松尾（03/07の振替）+ミーティング＋掃除：袰川、中間、飯星、岡田
Cytoplasmic protein aggregates interfere with nucleocytoplasmic transport of protein and RNA.
Woerner AC, Frottin F, Hornburg D, Feng LR, Meissner F, Patra M, Tatzelt J, Mann M, Winklhofer KF, Hartl FU,
Hipp MS. Science.
2016 Jan 8;351(6269):173-6. doi: 10.1126/science.aad2033. Epub 2015 Dec 3.JC飯星：袰川、中間、松尾、岡田
Drug-induced histone eviction from open chromatin contributes to the chemotherapeutic effects of doxorubicin.
Pang B, Qiao X, Janssen L, Velds A, Groothuis T, Kerkhoven R, Nieuwland M, Ovaa H, Rottenberg S, van Tellingen O,
Janssen J, Huijgens P, Zwart W, Neefjes J. Nat Commun. 2013;4:1908. doi: 10.1038/ncomms2921.
03/31 論文アクセプト！魚住さん、松本さん、がんばりました！
Title: Detection of O-propargyl-puromycin with SUMO and ubiquitin by click chemistry at PML-nuclear bodies during
abortive proteasome activities Journal Title: Biochemical and Biophysical Research Communications (BBRC)
Naoki Uozumi; Hotaru Matsumoto; Hisato Saitoh.
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