分子細胞修飾学 斉藤研究室　Molecular and Cellular Modification Saitoh LABORATORY

令和元年(2019年4月～2020年3月）

明るく活動的な4年生5名＋準メンバーが加わって、にぎやかで楽しい（つらい？）1年でした。分子生物学会には7名の学生さんが参加して、4名もの学生さんがワークショップで口頭発表しました。お疲れさまでした。卒業してラボを離れる人、残る人、皆さんのご健康とご活躍を願っております。

R01年度ラボメンバー
教員　斉藤　寿仁　教授
大学院博士課程後期1年　岡田 咲耶（特別研究員DC1）
大学院博士課程前期2年　髙鉾 結衣
大学院博士課程前期1　小林 桃子・深井 裕太・宮崎 航平
4年生　有村 悠・清水 菜未・馬締 竜平・松本 菜月・吉元 文哉
2年生　出口 ゆい（JRF: Junior Research Fellow)

スケジュール

4月

04/02 お花見ピクニック（北キャンパス法学部・文学部前）＊から王弁当+α

04/08 JC#1 斉藤：岡田、小林、深井、宮崎、有村、清水、馬締、松本、吉元、出口＋meeting+clean-up
Phosphoinositide Interactions Position cGAS at the Plasma Membrane to Ensure Efficient Distinction between Self- and Viral DNA. Barnett KC, Coronas-Serna JM, Zhou W, Ernandes MJ, Cao A, Kranzusch PJ, Kagan JC. Cell. 2019 Mar 7;176(6):1432-1446.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.01.049. Epub 2019 Feb 28.

04/15 JC#2開始8:50～ 小林：岡田、高鉾、深井、宮崎、有村、清水、馬締、松本、吉元、出口＋meeting+clean-up
Liquid-liquid phase separation of the microtubule-binding repeats of the Alzheimer-related protein Tau. Ambadipudi S, Biernat J, Riedel D, Mandelkow E, Zweckstetter M. Nat Commun. 2017 Aug 17;8(1):275. doi: 10.1038/s41467-017-00480-0.
04/18 くすのき会館にて3年生歓迎会
04/22 JC#3開始8:50～　岡田：高鉾、小林、深井、宮崎、有村、清水、馬締、松本＋meeting+clean-up
Cell Membranes Resist Flow. Shi Z, Graber ZT, Baumgart T, Stone HA, Cohen AE. Cell. 2018 Dec 13;175(7):1769-1779.e13. doi: 10.1016/j.cell.2018.09.054. Epub 2018 Nov 1.

04/25（木） 斉藤研キックオフシンポジウム at C216（3～4月分のPR2を含む）高鉾、吉元、馬締、岡田、有村、深井、 昼食会「ガパオ or ぶた大根 with 炊き立てご飯 & デザート：熊本産スイカ」 出口、宮崎、清水、松本、小林、斉藤
＊04/27-05/06 ゴールデンウィーク
（前半は曇・雨模様、後半は快晴。
この間、時代は平成から令和へ変わりました。）

5月

05/13 JC#4 松本 ＋meeting+clean-up
Gasset-Rosa F, Lu S, Yu H, Chen C, Melamed Z, Guo L, Shorter J, Da Cruz S, Cleveland DW. Neuron. 2019 Apr 17;102(2):339-357.e7. doi: 10.1016/j.neuron.2019.02.038. Epub 2019 Mar 7.
05/07-16 学生実習（3年生28名）TA: 高鉾、小林、深井、宮崎＋岡田
05/16 夕方～実習の打ち上げBBQ（4年生の方、準備ご苦労様でした！）

05/20 JC#5　宮崎 ＋meeting+clean-up
cGAS surveillance of micronuclei links genome instability to innate immunity. Mackenzie KJ, Carroll P, Martin CA, Murina O, Fluteau A, Simpson DJ, Olova N, Sutcliffe H, Rainger JK, Leitch A, Osborn RT, Wheeler AP, Nowotny M, Gilbert N, Chandra T, Reijns MAM, Jackson AP. Nature. 2017 Aug 24;548(7668):461-465. doi: 10.1038/nature23449. Epub 2017 Jul 24.
05/27 PR2岡田、高鉾、小林、深井、宮崎、有村、清水、馬締（後日：松本、吉元）＋meeting+clean-up

6月

06/03 JC#6深井 ＋meeting+clean-up
Reassessment of Exosome Composition. Jeppesen DK, Fenix AM, Franklin JL, Higginbotham JN, Zhang Q, Zimmerman LJ, Liebler DC, Ping J, Liu Q, Evans R, Fissell WH, Patton JG, Rome LH, Burnette DT, Coffey RJ. Cell. 2019 Apr 4;177(2):428-445.e18. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.029.
06/10 meeting+clean-up：高鉾、小林、深井、宮崎、吉元、有村、清水、松本
06/12 JC#7 馬締（06/10振替分）：高鉾、小林、深井、宮崎、吉元、有村、清水、松本
Nuclear lipid droplets derive from a lipoprotein precursor and regulate phosphatidylcholine synthesis. So?tysik K, Ohsaki Y, Tatematsu T, Cheng J, Fujimoto T. Nat Commun. 2019 Jan 28;10(1):473. doi: 10.1038/s41467-019-08411-x. Erratum in: Nat Commun. 2019 Mar 12;10(1):1230.
06/17 JC#8 有村 ＋meeting+clean-up：岡田、高鉾、小林、宮崎、深井、吉元、馬締、清水、松本
G-quadruplex DNA drives genomic instability and represents a targetable molecular abnormality in ATRX-deficient malignant glioma. Wang Y, Yang J, Wild AT, Wu WH, Shah R, Danussi C, Riggins GJ, Kannan K, Sulman EP, Chan TA, Huse JT. Nat Commun. 2019 Feb 26;10(1):943. doi: 10.1038/s41467-019-08905-8.
06/24 PR2 ＋meeting+clean-up：岡田、高鉾、小林、宮崎、吉元、馬締、有村、清水、松本、出口

7月

07/01 JC#9 吉元 ＋meeting+clean-up：宮崎、深井、馬締、清水、松本、出口
Tumour cell blebbing and extracellular vesicle shedding: key role of matrikines and ribosomal protein SA. Brassart B, Da Silva J, Donet M, Seurat E, Hague F, Terryn C, Velard F, Michel J, Ouadid-Ahidouch H, Monboisse JC, Hinek A, Maquart FX, Ramont L, Brassart-Pasco S. Br J Cancer. 2019 Feb;120(4):453-465. doi: 10.1038/s41416-019-0382-0. Epub 2019 Feb 11.
07/08 JC#10 高鉾 ＋meeting+clean-up：岡田、宮崎、深井、小林、有村、馬締、吉元、清水、松本、出口
RNA phase transitions in repeat expansion disorders. Jain A, Vale RD. Nature. 2017 Jun 8;546(7657):243-247. doi: 10.1038/nature22386. Epub 2017 May 31.
07/15 祝日
07/16 （火）meeting+clean-up
07/22 JC#11 清水 ＋meeting+clean-up：岡田、高鉾、宮崎、深井、小林、有村、馬締、吉元
In Vitro Membrane Remodeling by ESCRT is Regulated by Negative Feedback from Membrane Tension. Booth A, Marklew CJ, Ciani B, Beales PA. iScience. 2019 Apr 20;15:173-184. doi: 10.1016/j.isci.2019.04.021. [Epub ahead of print]
07/29 PR2 （岡田、深井、清水、吉元）＋meeting+clean-up＋イナバのカレー＋パイナップルパーティー at C216
07/30 PR2 （高鉾、有村、宮崎、馬締、小林）＋素麺＋水羊羹パーティーat C216
07/30 第42回分子生物学会（博多）参加申し込みの要旨締め切り

8月

*8月中はPR2 ＋meeting+clean-upはお休みします

08/22-23 大学院自然科学研究部入学試験
有村さん、馬締君、合格おめでとう！しっかり研究していきましょう！
08/30 プロゼミM2（高鉾）

9月

*9月1-3週はmeeting+clean-upはお休みします

09/10 研究室旅行（球磨川ラフティング）Lab trip to Kumagawa river

09/18 Ms. Bettina Catlin Molina Coz, Arrival at Kumamoto Univ.
09/24 Meeting +clean-up+松本さんドイツ留学の紹介+Luncheon (Inaba-curry with steamed rice)
09/25 1:00-3:00 PR2 Okada, Kobayashi, Deguchi, Miyazaki
09/26 1:00-5:00 PR2 ＋Others
09/30 9:30～ JC#1 斉藤Saitoh＋meeting+clean-up
Schueder et al. The nucelous functions as a phase-separated protein quality control compartment. Science 365, 342-347 (2019): Take Home「疲れてる？ゆっくりしてよ。核内で。」

10月

10/07 JC#2 宮崎Miyazaki＋meeting+clean-up：岡田、高鉾、深井、小林、有村、清水、馬締、清水、松本、吉元、出口
Willan et al. ESCRT-III is necessary for the integrity of the nuclear envelope in micronuclei but is aberrant at ruptured micronuclear envelopes generating damage. Oncogenesis (2019) 8:29「寒いとき、着るのはL? M? S? コート」
10/11 お昼休みの時間帯 at C216：3年生に向けての研究室紹介
10/14 祝日：JCお休み
10/05 meeting+clean-up：岡田、高鉾、深井、宮崎、小林、有村、清水、馬締、清水、松本、吉元
10/21 JC#3 有村Arimura＋meeting+clean-up
B.A. Gibson et al. organization of chromatin by intrinsic and regulated phase separation. Cell 179, 470-484 (2019)
10/28 PR2 13：00～小林、宮崎、深井、馬締、有村＋meeting+clean-up
10/29 PR2 9：30～岡田、高鉾、清水、松本、吉元

11月

11/04 祝日・紫熊祭のためJCはお休み
11/05 meeting+clean-up
11/11 （JC #4馬締→12/19木に延期）＋meeting+clean-up：岡田、深井、宮崎、小林、有村、清水、松本、吉元、出口
11/18 JC #5吉元＋meeting+clean-up：高鉾、岡田、深井、宮崎、小林、有村、清水、松本、馬締
C.R. Shurer et al. Physical principles of membrane shape regulation by the glycocalyx. Cell 177, 1757-1770 (2019)
11/18～ クリスマスツリー組み立て開始
11/25 PR2 （分生発表予定の方は発表の予行練習も兼ねてください）＋meeting+clean-up
11/28 分性生物学会・口頭発表予行（宮崎、小林、有村、馬締）

12月

3年生新メンバー（木佐貫 玲央、大塚 碧、渡部 一輝、伊達 日向）が加わりました！
12/02 JC #6清水Shimizu＋meeting+clean-up：高鉾、岡田、深井、宮崎、小林、有村、清水、松本、吉元、馬締、木佐貫、大塚、渡部、伊達
C. Brownlee and R. Heald. Importin alpha partitioning to the plasma membrane regulates intracellular scaling. Cell 176, 805-815 (2019)
12/03-06 第42回日本分子生物学会・博多（福岡国際会議場＋福岡サンパレス＋マリンメッセ）

12/03 ワークショップ
1AW-08「核輸送コンポーネントのインタープレイをもたらす細胞核ダイナミクス」
・宮崎航平「微小核における核膜構造のバリエーションとゲノム不安定性の制御」
1PW-04「細胞恒常性をつかさどるプロテオスタシス」
・小林桃子　アミロイド化したタンパク質の核小体とPMLボディでの集積とその制御
12/05 ワークショップ
3AW-17「細胞核地勢学」
・有村悠「グアニン4重鎖オリゴDNAの細胞導入による核とクロマチン構造変化」
3PW-17「細胞核を造る」
・馬締竜平「脂肪酸による脂肪滴の誘導と核・染色体の空間制御」
12/05 ポスター「3-a細胞の構造と機能－染色体・核内構造体」
・3P-0211宮崎航平「微小核における核膜構造のバリエーションとゲノム不安定性の制御」
・3P-0212 馬締竜平「脂肪酸による脂肪滴の誘導と核・染色体の空間制御」
・3P-0213有村悠「グアニン4重鎖オリゴDNAの細胞導入による核とクロマチン構造変化」
・3P-0214小林桃子「アミロイド化したタンパク質の核小体とPMLボディでの集積とその制御」
12/04 ポスター「6-d方法論・技術－ケミカルバイオロジー」
・4P-0629 岡田咲耶「化学物質による細胞膜表層と細胞外ベシクルの動態操作」
・4P-0630 深井裕太「ヒト細胞由来の大型細胞外ベシクルGPMVsの高度精製とタンパク質、RNA、糖鎖構成因子の解析」
・4P-0631 吉元文哉「細胞膜ブレッブとベシクルの異なる細胞株間での比較」

12/09 JC #7高鉾＋meeting+clean-up：岡田、深井、宮崎、小林、有村、清水、松本、吉元、馬締、木佐貫、大塚、渡部、伊達
O. Laufman et al. viral generated inter-organelle contacts redirect lipid flux for genome replication. Cell 178, 275-289 (2019)
12/10 (2限)学会報告会＋ミーティング：岡田、深井、吉元、宮崎、小林、有村、出口：高鉾、清水、松本、木佐貫、大塚、渡部、伊達
12/11 R02年度卒研テーマの決定！
12/12(木) 14:30-15:30 防災訓練
12/13 プロゼミ発表予行
12/14(土) 10:30～ プロゼミM1（小林、深井、宮崎）+D1（岡田）
12/16 JC #8松本Matsumoto＋meeting+clean-up：岡田、宮崎、小林、有村、清水、馬締、清水、松本、吉元、木佐貫、大塚、渡部、伊達
Z. Nil et al. Amyloid-like assembly activates a phosphatase in the developing Drosophila embryo. Cell 178, 1403-1420 (2019)
12/19(木) 3限 JC #4 &学会報告（11/11と12/10の振り替え）馬締：キャンセル ミーティング「巨人の肩の上に立つ」岡田、宮崎、有村、清水、松本、木佐貫、大塚、渡部、伊達
12/23 PR2 9:30 am～ 高鉾、有村、清水、馬締、松本、吉元；1:00 pm～ 岡田、小林、宮崎、深井、3年生
12/24 大掃除＋新メンバー歓迎会＋忘年会＋クリスマスパーティー 「チキン＆ホットケーキパーティー」

2020年(令和2年)1月

01/06(月) JC #9(9:30 am～)岡田：高鉾、宮崎、小林、深井、有村、清水、馬締、松本、吉元、木佐貫、大塚、渡部、伊達＋meeting+clean-up＋有志による藤崎八幡宮への初詣岡田、宮崎、小林、有村、清水、馬締、清水、松本、吉元、木佐貫、大塚、渡部、伊達
H. Huang et al. Glutamate signaling at cytoneme synapses. Science 363, 948-955 (2019)
01/08(水) 大学授業開始
01/14 祝日のためJCはお休み
01/15 meeting+clean-up

1/17(金) 17:00 (研究室内)修論提出締め切り01/20 JC #10深井＋meeting+clean-up
C. Crewe et al. An endotherial-to-adipocyte extracellular vesicle axis govered by metabolic state. Cell 175, 695-708 (2018)
1/24(金) 17:00 (研究室内)卒論提出締め切り⇒査読開始
01/27 PR2＋meeting+clean-up
01/29(水) 17:00 修士論文提出締め切り(1回目)→査読開始
01/31(金) 17:00 卒論提出締め切り

2月

02/03⇒02/04 JC #11小林＋meeting+clean-up：高鉾、宮崎、小林、深井、有村、清水、馬締、清水、松本、吉元、木佐貫、大塚、伊達
L. Median et al. Defective ribosomal products challenge nuclear function by impairing nuclear condensate dynamics and immobilizing ubiquitin. EMBO J. 38: e101341 (2019)
2/4 ベトナム高校生・ラボ訪問＋授業 at C216+実習(自分の細胞を観察する)
2/5 卒研発表予行
02/06-07 卒研発表会
02/10 meeting+clean-up
02/10 17:00 修士論文提出締め切り(2回目)
02/13 修論発表会
02/14 追いコン at くすのき会館、その後、「和」にて研究室打ち上げパーティー
02/17 meeting+clean-up：高鉾、岡田、小林、深井、有村、木佐貫、伊達、出口

02/24 祝日振替のためお休み
02/25(火) 大学入学試験(前期)
02/27(木) PR2＋meeting+clean-up 岡田、宮崎、小林、深井、有村、馬締、木佐貫、大塚、伊達、渡部。出口

3月

3/5(木) 午後1:00～薬品整理：岡田、深井、宮崎、有村、馬締
3/23 宮川玲花さん、R02年度JRF採択！おめでとう！！新発見、期待しています！
3/24 卒業式・修了式：卒業・修了おめでとう！
新型コロナウイルスのため中止、研究室で証書を渡しました！