今年度は河田さんのNETsの論文が2報出て研究室として新機軸を出すことができました。山田さん、斉藤さん、森山さんのM2トリオが大いに頑張ってくれたおかげで、論文発表や学会発表など多くの研究業績を残せました。4年生とは一緒に金峰山周辺をドライブして、名物のだご汁を堪能しました。果樹園のおばあさんの名講義が耳に残ります。
4月
03/28 お花見ランチ & 北キャンパス散策＋五高記念館
04/01 ミーティング＋掃除
04/08 JC/SC#1斉藤（寿）＋ミーティング＋掃除：中山、桝田、村上、湯浅
Single-cell dynamics of genome-nuclear lamina interactions. Kind J, Pagie L, Ortabozkoyun H, Boyle S, de Vries SS,
Janssen H, Amendola M, Nolen LD, Bickmore WA, van Steensel B. Cell. 2013 Mar 28;153(1):178-92. doi:
10.1016/j.cell.2013.02.028. Epub 2013 Mar 21.
04/15 PR2：中山、桝田、湯浅
ミーティング＋掃除：森山、中山、桝田、村上、湯浅
04/22 JC/SC#2 中山＋斉藤（雅）＋ミーティング＋掃除：山田、森山、桝田、村上、湯浅
The permeability of reconstituted nuclear pores provides direct evidence for the selective phase model.
Hülsmann BB, Labokha AA, Görlich D. Cell. 2012 Aug 17;150(4):738-51. doi: 10.1016/j.cell.2012.07.019.
04/28 ミーティング＋そうじ：森山、中山、桝田
|
5月
05/07 9:30- PR2：ミーティング＋掃除：中山、桝田、村上、湯浅
05/10（金） H25年度キックオッフカンファレンス＋懇親会 森山、中山、桝田、村上、湯浅
05/13 ミーティング＋掃除
05/16 JC#3桝田＋森山: 中山、桝田、湯浅
Dynamic readers for 5-(hydroxy)methylcytosine and its oxidized derivatives. Spruijt CG, Gnerlich F, Smits AH,
Pfaffeneder T, Jansen PW, Bauer C, Munzel M, Wagner M, Muller M, Khan F, Eberl HC, Mensinga A, Brinkman AB,
Lephikov K, Muller U, Walter J, Boelens R, van Ingen H, Leonhardt H, Carell T, Vermeulen M. Cell.
2013 Feb 28;152(5):1146-59. doi: 10.1016/j.cell.2013.02.004. Epub 2013 Feb
05/20 河田、プロゼミ発表予行
JC#4 村上＋河田：斉藤（雅）、森山、中山、桝田、湯浅＋ミーティング＋掃除
Genome-wide Analysis Reveals TET- and TDG-Dependent 5-Methylcytosine Oxidation Dynamics.
Shen L, Wu H, Diep D, Yamaguchi S, D'Alessio AC, Fung HL, Zhang K, Zhang Y. Cell. 2013 Apr 25;
153(3):692-706. doi: 10.1016/j.cell.2013.04.002. Epub 2013 Apr
05/24 プロゼミ 河田
05/27 エピ研発表予行：森山
JC#5 斉藤（寿）：森山、桝田、村上、湯浅
Structural and molecular interrogation of intact biological systems. Chung K, Wallace J, Kim SY, Kalyanasundaram S,
Andalman AS, Davidson TJ, Mirzabekov JJ, Zalocusky KA, Mattis J, Denisin AK, Pak S, Bernstein H, Ramakrishnan C,
Grosenick L, Gradinaru V, Deisseroth K. Nature. 2013 May 16;497(7449):332-7. doi: 10.1038/nature12107. Epub 2013
ミーティング＋掃除：斉藤（雅）、森山、桝田、村上、湯浅
05/30-31 第７回日本エピジェネティクス研究会（奈良県新公会堂：斉藤（寿）、斉藤（雅）、森山
P-54: DNA脱メチル化因子Thimine DNA Glycosylase (TDG)のSUMO修飾による機能制御
森山大志、浦野健、菅澤薫、斉藤寿仁
P-143: SUMO修飾とSUMO相互作用因子によるゲノムとエピゲノムの管理
斉藤雅幸、斉藤寿仁
|
6月
06/03 9:30- エピ研報告会：斉藤（寿）、斉藤（雅）、桝田、湯浅＋ミーティング＋掃除
06/10 9:30- JC/SC#5 湯浅＋山田：斉藤（雅）、桝田、中山、湯浅＋ミーティング＋掃除
Profiling of ubiquitin-like modifications reveals features of mitotic control. Merbl Y, Refour P, Patel H, Springer M,
Kirschner MW. Cell. 2013 Feb 28;152(5):1160-72. doi: 10.1016/j.cell.2013.02
06/17 9:30- ミーティング＋掃除：山田、斉藤（雅）、桝田、中山、湯浅
06/20 9:30- PR2（Progress Report & Public Relations）発表：斉藤（雅）、森山、桝田、湯浅
06/24 9:30- JC/SC#6斉藤（雅）＋桝田、ミーティング＋掃除：山田、森山、中山、村上、湯浅
Acetylation-Mediated Proteasomal Degradation of Core Histones during DNA Repair and Spermatogenesis.
Qian MX, Pang Y, Liu CH, Haratake K, Du BY, Ji DY, Wang GF, Zhu QQ, Song W, Yu Y, Zhang XX, Huang HT, Miao S,
Chen LB, Zhang ZH, Liang YN, Liu S, Cha H, Yang D, Zhai Y, Komatsu T, Tsuruta F, Li H, Cao C, Li W, Li GH,
Cheng Y, Chiba T, Wang L, Goldberg AL, Shen Y. Cell. 2013 May 23;153(5):1012-24. doi: 10.1016/j.cell.2013.04.032.
|
7月
07/01 PR2 山田、斉藤（雅）、中山、村上＋掃除：森山、桝田、湯浅
07/08 JC/SC#7 森山（大）＋湯浅、ミーティング＋掃除：山田、斉藤（雅）、中山、桝田、村上
Tet proteins connect the O-linked N-acetylglucosamine transferase Ogt to chromatin in embryonic stem cells.
Vella P, Scelfo A, Jammula S, Chiacchiera F, Williams K, Cuomo A, Roberto A, Christensen J, Bonaldi T, Helin K,
Pasini D. Mol Cell. 2013 Feb 21;49(4):645-56. doi: 10.1016/j.molcel.2012.12.019. Epub 2013
07/15 海の日（JC/SCキャンセル）
07/16 ミーティング＋掃除：中山、桝田、村上、湯浅
07/22 PR2：斉藤（雅）、森山、桝田、湯浅；山田、村上
ミーティング＋掃除
07/24-26 広瀬進先生（国立遺伝学研究所・名誉教授）
学部特別講義
07/25 広瀬先生歓迎会（幹事：森山）
07/26 プロゼミ広瀬進先生
「クロマチンの境界におけるヒストンH3.3 置換」
07/29 JC/SC#8 山田＋村上；斉藤（雅）、森山、桝田、湯浅、
中山、 ミーティング＋掃除
Role of Cdc48/p97 as a SUMO-targeted segregase
curbing Rad51-Rad52 interaction. Bergink S, Ammon T,
Kern M, Schermelleh L, Leonhardt H, Jentsch S. Nat Cell
Biol. 2013 May;15(5):526-32. doi: 10.1038/ncb2729.
Epub 2013 Apr 28.
07/31 プロゼミ発表予行：斉藤（雅）、森山：中山、桝田、湯浅
|
8月
08/03 プロゼミ: 斉藤（雅）、森山
08/09 JC/SC#9河田＋中山；斉藤（雅）、森山：桝田、湯浅 ミーティング＋掃除
Rhythmic modulation of the hematopoietic niche through neutrophil clearance. Casanova-Acebes M, Pitaval C,
Weiss LA, Nombela-Arrieta C, Chevre R, A-Gonzalez N, Kunisaki Y, Zhang D, van Rooijen N, Silberstein LE,
Weber C, Nagasawa T, Frenette PS, Castrillo A, Hidalgo A. Cell. 2013 May 23;153(5):1025-35. doi:
10.1016/j.cell.2013.04.040.
08/10 オープンキャンパス
斉藤研企画「細胞を見てみよう」
08/19 掃除；山田、斉藤（雅）、桝田、村上、湯浅
08/21-22 大学院入試
|
9月
09/02 掃除：桝田、湯浅
09/09 ランチョンミーティング（タイ風カレー）＋掃除
09/11-13 第86回日本生化学会大会（横浜）河田
2P-306 「ヒト成熟好中球トHL60細胞を用いた分葉核と脱凝縮クロマチンネットワークの解析」河田仁、斉藤寿仁
2P-312 「セミインタクト細胞を用いたSUMO修飾システムの制御基盤の解析」斉藤寿仁、湯浅映里、中山智文、
桝田実紗妃、村上真隆
09/17 掃除 森山、中山、桝田、湯浅
09/24 JC#1 河田 with 湯浅；中山、桝田、村上
Neutrophil extracellular traps mediate a host defense response to human immunodeficiency virus-1. Saitoh T,
Komano J, Saitoh Y, Misawa T, Takahama M, Kozaki T, Uehata T, Iwasaki H, Omori H, Yamaoka S, Yamamoto N,
Akira S. Cell Host Microbe. 2012 Jul 19;12(1):109-16. doi: 10.1016/j.chom.2012.05.015.
09/25 金峰山周遊 with 4年生（峠の茶屋、果樹園、霊巌洞、五百羅漢、江津湖）
湯浅、桝田、中山、村上
09/30 PR2 村上、湯浅、桝田、中山：森山、斉藤（雅）
|
10月
10/07 JC#2 中山 with 森山：桝田、村上、湯浅
p53 SUMOylation promotes its nuclear export by facilitating its release from the nuclear export receptor CRM1.
Santiago A, Li D, Zhao LY, Godsey A, Liao D. Mol Biol Cell. 2013 Sep;24(17):2739-52. doi:
10.1091/mbc.E12-10-0771. Epub 2013 Jul 3.
10/15 ミーティング＋掃除：斉藤（雅）、森山、中山、桝田、村上、湯浅
10/21 JC#3 湯浅 with 斉藤（雅）：森山、中山、桝田、村上
Uhrf1-dependent H3K23 ubiquitylation couples maintenance DNA methylation and replication. Nishiyama A,
Yamaguchi L, Sharif J, Johmura Y, Kawamura T, Nakanishi K, Shimamura S, Arita K, Kodama T, Ishikawa F,
Koseki H, Nakanishi M. Nature. 2013 Sep 8. doi: 10.1038/nature12488. [Epub ahead of print]
10/28 PR2 山田、斉藤（雅）、森山；中山、桝田、村上、湯浅＋ミーティング＋掃除：
|
11月
11/05 JC#4 桝田 with 山田；斉藤（雅）、中山、湯浅
Nuclear PTEN controls DNA repair and sensitivity to genotoxic stress. Bassi C, Ho J, Srikumar T, Dowling
RJ, Gorrini C, Miller SJ, Mak TW, Neel BG, Raught B, Stambolic V. Science. 2013 Jul
26;341(6144):395-9. doi: 10.1126/science.1236188.
11/11 PR2 4年生
11/15 JC#5 村上 with 河田: 山田、斉藤（雅）、森山、中山、桝田、湯浅
Vitamin C induces Tet-dependent DNA demethylation and a blastocyst-like state in ES cells. Blaschke K,
Ebata KT, Karimi MM, Zepeda-Martinez JA, Goyal P, Mahapatra S, Tam A, Laird DJ, Hirst M, Rao A,
Lorincz MC, Ramalho-Santos M. Nature. 2013 Aug 8;500(7461):222-6. doi:
10.1038/nature12362. Epub 2013 Jun 30.
11/12-14 3年実習
11/18 JC#6 森山 with 桝田 ：山田、斉藤（雅）、中山、村上、湯浅
SENP1 and SENP2 affect spatial and temporal control of sumoylation in mitosis.
Cubenas-Potts C, Goeres JD, Matunis MJ. Mol Biol Cell. 2013 Nov;24(22):3483-95. doi:
10.1091/mbc.E13-05-0230. Epub 2013 Sep 18. PMID: 24048451
＊クリスマスツリー組み立て
11/19-21 3年実習
11/21 ボジョレー＋チーズフォンデュ
11/25 PR2 分子生物学会発表予定者による発表の予行練習：
斉藤（雅）、森山、中山、桝田、湯浅；山田、村上
|
12月
12/02 JC#7 山田 with 村上：斉藤（雅）、森山、中山、桝田、湯浅
The nuclear pore regulates GAL1 gene transcription by controlling the localization of the SUMO protease
Ulp1. Texari L, Dieppois G, Vinciguerra P, Contreras MP, Groner A, Letourneau A, Stutz F. Mol Cell. 2013
Sep 26;51(6):807-18. doi: 10.1016/j.molcel.2013.08.047.
12/03-06 分子生物学会（神戸ポートアイランド）
2P-0130 ○湯浅 映里, 斉藤 寿仁：DNA複製部位におけるヒストンシャペロンCAF1のp150サブユニットと
SUMO-2/3の相互作用に関する研究
2P-0151 ○森山 大志, 浦野 健, 菅澤 薫, 斉藤 寿仁：DNA脱メチル化酵素TDGのSUMO化修飾による機能制御
2P-0152 ○桝田 実紗妃, 森山 大志, 村上 真隆, 斉藤 寿仁：塩基除去修復反応でDNA脱メチル化を制御する
DNAグリコシラーゼＴＤＧの機能ドメインの解析
2P-0324 ○中山 智文, 斉藤 寿仁：in situ SUMO化反応系を用いた核膜孔SUMO-E3リガーゼRanBP2/Nup358の
活性制御に関する研究
2P-0325 河田 仁, 菊池 亮, ○斉藤 寿仁：好中球の分化と成熟に伴う細胞核の分子構造変換に関する研究
2P-0326 ○斉藤 雅幸, 浦野 健, 斉藤 寿仁：DNAトポイソメラーゼII阻害剤Etoposideで処理した染色体への
SUMO化依存的ユビキチンリガーゼRNF4の蓄積
12/09 分子生物学会報告会：斉藤、森山、中山、桝田、湯浅；村上
新メンバー（3年生）配属決定：
三原佳子さん、森 健吾さん、松本 蛍さん
12/13 新メンバーを囲む昼食会 at 南食堂
12/16 9:30 ミーティング＋掃除 森山、村上、桝田、三原、森、松本
12/17 PR2 山田、村上：斉藤（雅）、中山、桝田、湯浅、三原、森、松本
12/20 JC#8 斉藤（雅） with 中山
Single-cell Hi-C reveals cell-to-cell variability in chromosome structure. Nagano T, Lubling Y, Stevens TJ,
Schoenfelder S, Yaffe E, Dean W, Laue ED, Tanay A, Fraser P. Nature. 2013 Oct 3;502(7469):59-64. doi:
10.1038/nature12593. Epub 2013 Sep 25.
12/25 10:00-12:00 大掃除
|
1月
01/06 藤崎宮へ初詣に行きましょう！その後、Luncheon新年会
JC 斉藤(寿)Dynamic Imaging of Genomic Loci in Living Human Cells by an
Optimized CRISPR/Cas System.Chen B, Gilbert LA, Cimini BA, Schnitzbauer J,
Zhang W, Li GW, Park J, Blackburn EH, Weissman JS, Qi LS, Huang B.Cell. 2013
Dec 19;155(7):1479-91. doi: 10.1016/j.cell.2013.12.001
01/07 10:00〜11:00 SUMO研究会発表予行：山田、湯浅 ＊発表10分程度
斉藤(雅)、森山、村上、桝田、中山、三原、森、松本
01/08 予定していたW.C. Earnshaw先生セミナー＋ランチョンミーティングは
Canceledとなりました。残念。
01/10-11 SUMO-XI at RIKEN at 和光；山田、湯浅、斉藤（寿）
01/14 SUMO-XI報告会＋ミーティング＋掃除：山田、湯浅、斉藤（寿）
森山、村上、桝田、中山、三原、松本
01/20 ミーティング＋掃除 （M2と4年生は随時、個別相談会）
山田、村上、桝田、中山、三原、松本
01/23 河田発表予行(発表40分、質疑応答20分)：山田、斉藤(雅)、森山、村上、中山、
桝田、湯浅、三原、森
01/27 ミーティング＋掃除山田、斉藤(雅)、森山、村上、中山、桝田、湯浅、三原、松本
01/27 研究室修士論文提出締め切り・研究室内査読開始
01/28 博士論文発表会・審査会（河田）
01/31 研究室卒業論文提出締め切り・研究室内査読開始
|
2月
02/03 ミーティング＋そうじ：山田、斉藤(雅)、森山、村上、中山、桝田、森、三原、松本
02/03 修論締切：（第一回）
02/04 JC #11 斉藤(寿)
Bidirectional developmental potential in reprogrammed cells with acquired pluripotency. Obokata H, Sasai
Y, Niwa H, Kadota M, Andrabi M, Takata N, Tokoro M, Terashita Y, Yonemura S, Vacanti CA, Wakayama
T. Nature. 2014 Jan 30;505(7485):676-80. doi: 10.1038/nature12969.
Stimulus-triggered fate conversion of somatic cells into pluripotency. Obokata H, Wakayama T, Sasai Y,
Kojima K, Vacanti MP, Niwa H, Yamato M, Vacanti CA. Nature. 2014 Jan 30;505(7485):641-7. doi:
10.1038/nature12968.
02/07 卒論提出締切
02/10 卒論の研究室内発表予行:中山、桝田、村上、湯浅：山田、斉藤、
松本、三原
02/12 修論発表の研究室内発表予行：山田、斉藤、森山：中山、桝田、
村上、湯浅、松本、三原
02/12 改訂版の修士論文提出締切
2月13日（木）‐14日（金） 卒論発表会 （発表８分、質疑応答４分）
02/13 発表反省会&Dinner at C216（とり釜めし、ハンバーグ）
2月17日（月）‐18日（火） 修論発表会
＊森山大志君、ベストプレゼン賞受賞！おめでとう！！
02/17 発表反省会＆Dinner at C216（タイ風カレー、ミートボール）
02/18 生物コース歓送会 at くすのき会館
研究室追いコン at 旬魚旬菜(月駕町店)
02/24 ミーティング＋掃除：森山、中山、三原
|
3月
03/03 ミーティング＋掃除：森山、三原、松本
03/10 ミーティング＋掃除：森山、桝田、三原
03/17 ミーティング＋掃除：森山、中山、湯浅、松本
03/24 ミーティング＋掃除：桝田、松本
03/25 卒業式 2:00-3:00コース別学位授与式
3:00〜4:00頃、研究室で茶話会
|
|
