分子細胞修飾学 斉藤研究室 Molecular and Cellular Modification Saitoh LABORATORY

令和3年度(2021年4月〜2022年3月)

2021(令和3)年度も終わりました。今年は博士課程3年の岡田さんが学位を取りました。彼女はJRFとして学部2年生で研究室に配属され、学部4年と大学院の修士2年を飛び級し、学部入学から合計7年で博士号を取得しました。理学部の歴史始まって最速の学位取得だったと思います。快挙です!頑張りましたね。これに続く学生さんを期待します。
また、今年度は2名の修士課程、3名の学部生の皆さんがそれぞれ大変独創的な研究テーマをまとめて、卒業・修了しました。皆さんと一緒に研究ができて、大変面白かったです。
さて、今年度はワクチン接種で体調を崩した学生さんも多くいましたね。新型コロナが収束しない状況の中で、これからの日本はデジタル化・オンライン化が急速に進むでしょう。皆さんはこうした新しい生活スタイルの先導者なのです。これまでにないライフスタイルを積極的に提案、実施していってください。そこには新たなチャンスがたくさんあると思います。今後、いろいろな困難があると思いますが、ここで学んだ発想力と計画力、実行力、そして人間力を携えて未来を切り開いていってください。困ったことがあったら、また大学にお立ち寄りください。理学部1号棟C216号室でディスカッションしましょう。

R03年度ラボメンバー
教員 斉藤 寿仁 (教授)
大学院博士課程後期3年 岡田 咲耶(特別研究員DC1)
大学院博士課程前期2年 有村 悠・馬締 竜平
大学院博士課程前期1年 木佐貫 玲央・伊達 日向・渡部 一輝
卒研生 4年 磯部 帆南・小川 耕生・山﨑 優花
JRF 3年 宮川 玲花
JRF 2年 東 有里紗

スケジュール

令和3年度(2021年)4月

03/31 原田信志学長の退任式
04/01 小川久雄学長の就任式
04/04 学部・大学院入学式 at 県立劇場
04/05(月) 9:30〜 研究室ガイダンス+meeting+
clean-up+ランチョン
04/08 午前10時〜3年ガイダンス
午後1時30分〜4年ガイダンス
午後15時〜大学院ガイダンス

04/12 AM9:30〜JC#1 木佐貫+meeting+掃除:岡田、伊達、渡部、小川、山﨑、宮川、東
Li et al. Phosphorylation and chromatin thethering prevent cGAS activation during mitosis. Science 10.1126/science.abc5386 (2021)
04/12 大学院の授業開始
〜04/12 04/12までに修士副指導教員(2〜3名)の希望調査→〜04/19までに副指導教員の決定
04/14 学部の前期・第1ターム開始
04/19 新型コロナウイルスのリスクレベル4 になりました!
04/19 AM 9:30〜 Meeting +clean-up:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、渡部、小川、山﨑、宮川

04/20 AM10:25〜JC#2渡部:岡田、伊達、木佐貫、小川、山﨑、磯部、宮川、東
Shoshani et al. Chromothripsis drives the evolution of gene amplification in cancer. Nature 591, 137-141 (2021)
*ZoomでJCを行いました。
〜04/19 04/19までに卒研相談教員を決める(4年生) *Moodle経由で希望届を提出
04/26 AM 9:30〜 Meeting +clean-up:岡田、馬締、木佐貫、伊達、渡部、小川、宮川
04/27 斉藤研キックオフシンポジウム day 1:木佐貫、有村、小川、宮川、渡部
04/28 斉藤研キックオフシンポジウム day 2:伊達、馬締、山﨑、磯部、岡田、東
*Zoomでキックオフを行いました。新型コロナウイルスのリスクレベル5になりました!3密を避けろ!

5月

05/10 AM9:30〜 Meeting+clean-up:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、渡部、山ア、宮川、東
05/11 AM10:25〜(日時変更あり)JCは中止(3年実習ガイダンスのため)
05/11〜13 斉藤研担当の3年実習(前半)
*学内でのコロナ感染者増加のため、3日目の対面実習は中止となりました。学生の皆さんにはご迷惑をおかけしました。

05/17 AM8:40〜JC#3 宮川:岡田、有村、木佐貫、伊達、渡部、山ア、磯部、東
A. Uzaka et al. Responses of unicellular predators to cope with the phototoxicty of photosynthetic prey. Nature Commun. 10: 5606 (2019)
05/18〜20 斉藤研担当の3年実習(後半)
*コロナ感染拡大のため対面での実習は中止。Zoomのbreak out room機能を用いてのオンライン実習に変更。結構、面白かったですし、オンライン学習についていろいろ勉強になりました!TAの皆さん、ご苦労様でした!
05/24 AM9:30〜 Meeting+clean-up:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、渡部、山ア、宮川、東
05/25 JC#4 伊達:岡田、有村、馬締、渡部、山ア、磯部、宮川、東 Y. Johmura et al. Senolysis by glutaminolysis inhibition ameliorates various age-associated disorders. Science 371, 265-270 (2021)
05/31 PR2岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、渡部、山ア、磯部、小川、宮川、東
05/31 meeting+掃除:岡田、有村、伊達、渡部、山ア、磯部、小川、宮川、東

6月

06/07 meeting+掃除:岡田、有村、馬締、伊達、渡部、木佐貫、小川、宮川、東
06/08 JC#5小川:岡田、有村、伊達、渡部、木佐貫、磯部、山ア、宮川、東
D.J. Greenwood et al. Subcellular antibiotic visualization reveals dynamic drug reservoir in infected macrophages. Science 364, 1279-1282 (2019)
06/14 meeting+掃除:岡田、有村、伊達、渡部、木佐貫、磯部、小川、宮川、東
06/15 JC#6岡田: 有村、伊達、渡部、木佐貫、磯部、山ア、小川、宮川、東
S.E. Flahery III et al. A lipase-independent pathway of lipid release and immune modulation by adipocytes. Science 363, 989-993 (2019)
06/21 meeting+掃除:岡田: 有村、馬締、伊達、木佐貫、山ア、小川、宮川、東
06/22 JC#7有村:岡田: 馬締、伊達、木佐貫、山ア、磯部、小川、宮川、東
H. Strickfaden et al. Condensed chromatin behaves like a solid on the mesososcale in vitro and living cells. Cell 183, 1772-1784 (2020)
06/28 meeting+掃除

06/28〜30 PR2+ミーティング+掃除
プリン&アイスクリームパーティー at C216

7月

07/05 meeting+掃除:岡田、有村、馬締、伊達、木佐貫、磯部、小川、山ア、宮川
07/06 JC8馬締:岡田、有村、伊達、木佐貫、渡部、磯部、小川、山ア、宮川、東
H. Jiao et al. mitocytosis, a migrasome-mediated mitochondrial quality-control process. Cell 184, 2896-2910 (2021)
07/12 meeting+掃除:岡田、有村、馬締、伊達、渡部、磯部、小川、山ア、宮川
07/13 JC#9 山ア:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、渡部、磯部、小川、宮川、東
V.K. Dwivedi et al. Replication stress promotes cell elimination by extrusion. Nature 593, 591-596 (2021)
07/19 meeting+掃除:岡田、有村、馬締、伊達、木佐貫、渡部、磯部、小川、山ア、宮川
07/20 JC.#10磯部:岡田、有村、馬締、伊達、木佐貫、小川、山ア、宮川、東
R.A. Flynn et al. Small RNAs are modified with N-glycans and displayed on the surface of living cells. Cell 184, 3109-3124 (2021)
7/29 PR2岡田、有村、馬締、伊達、木佐貫、渡部、磯部、小川、山ア
土用の丑の日パーティー at C216号室

7/19〜7/26 ワクチン予約(学生)
07/01〜07/30 分子生物学会の発表演題登録締め切り

8月

08/19 大学院入試(出願期間7/22)
08/24 プロゼミ発表予行by岡田、有村、馬締:1:00PM~zoom岡田、有村、馬締、伊達、渡部、磯部、小川、山ア
08/26 プロゼミ発表(Dr & M2)at D201+zoom:岡田、有村、馬締が発表します!
*8月~9月中旬までJCとPR2はお休みの予定ですが、meeting+clean-upは隔週で継続予定
*JCとPR2は8月お休

9月

9月 新型コロナの感染拡大に伴う熊本蔓延防止宣言~9月30日まで
09/13 meeting+掃除:有村、馬締、伊達、磯部、小川、山ア、宮川、東
09/27 学部の後期・第3ターム開始
09/27−28 大学院集中講義:生物科学特別講義A(1単位)Zoom
宮本洋一博士(国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所)
09/27 プロゼミ「核―細胞質間タンパク質輸送に着目した創薬基盤研究」
宮本洋一博士(国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 Zoom
09/29−30 大学院教養教育・集中講義・技術革新のための基礎科学「動物行動学」(1単位)Zoom
吉井大志先生(岡山大学大学院自然科学研究科生物科学講座)
09/27 大学院の後期・第3ターム開始
*新型コロナ感染者が全国的に減少傾向!!

10月

10/01 PR2 (8・9月) 対面で再開です!岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、渡部、小川、宮川

10/07 JC#1 zoom 8:30AM~木佐貫:岡田、有村、馬締、伊達、小川、山ア、宮川、東
Warecki et al. ESCRT-II-mediated membrane fusion drives chromosome fragments through nuclear envelope channels.
J. Cell Biol. 219. e201905091 (2020)
10/11 9:30AM~ meeting+掃除:
10/13 研究室紹介(3年生)
10/14 JC#2 zoom 8:30AM~ 渡部:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、小川、磯部、山ア、宮川、東
Mechanisms generating cancer genome complexity from a single cell division error. Umbreit NT, Zhang CZ, Lynch LD, Blaine LJ, Cheng AM, Tourdot R, Sun L, Almubarak HF, Judge K, Mitchell TJ, Spektor A, Pellman D.Science.
2020 Apr 17;368(6488):eaba0712. doi: 10.1126/science.aba0712.
10/18 9:30AM~ meeting+掃除:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、小川、磯部、山ア、宮川、東
10/21 JC#3 zoom 8:30AM~ 有村:岡田、馬締、木佐貫、伊達、渡部、小川、磯部、山ア、宮川、東
Folkmann AW, Putnam A, Lee CF, Seydoux G. Regulation of biomolecular condensates by interfacial protein clusters.
Science. 2021 Sep 10;373(6560):1218-1224. doi: 10.1126/science.abg7071.
10/25 9:00AM~ PR2 at C227小川、磯部、山ア+meeting+掃除:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、宮川、東
10/28 9:00AM~ PR2 at C227岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、渡部、小川、磯部、山ア、宮川、東
⇒個別に対応する!

11月

11/01~03 開校記念日+大学祭など
11/04 JC#4(Zoom) 小川:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、磯部、山ア、宮川、東+meeting+掃除
Maximilian Schutter, Patrick Giavalisco, Susanne Brodesser, Martin Graef. Local Fatty Acid Channeling into Phospholipid Synthesis Drives Phagophore Expansion during Autophagy. Cell 180, 135?149 (2020)
11/11 JC#5 馬締:岡田、有村、木佐貫、伊達、磯部、小川、山ア、宮川+meeting+掃除(岡田、有村、磯部、小川、山ア、宮川)
Xu Z., Hueckel T., Irvine W.T., Sacanna S. Transmembrane transport in inorganic colloidal cell-mimics. Nature 597, 220-224 (2021)

11/12 9:30AM~ meeting+掃除:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、磯部、小川、山ア、宮川
11/18 JC#6 岡田:有村、馬締、木佐貫、伊達、磯部、小川、山ア、宮川、東
Alarcon-Martinez, L. et al. Interpericyte tunneling nanotubes regulate neurovascular coupling. Nature 585, 91-95 (2020)
11/18 クリスマスツリーの組み立て開始
11/22 9:00AM~ 学会発表予行:岡田、伊達+meeting+掃除:岡田、伊達、磯部、小川、山ア、宮川
11/24 3:00PM~ 学会発表予行:有村、馬締、木佐貫、渡部、宮川(以下、個別に:有村、馬締、木佐貫、宮川)
11/25 9:00AM~ PR2岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、磯部、小川、山ア、宮川、東
11/29 meeting+掃除:岡田、有村、馬締、伊達、磯部、山ア、宮川、東
11/30 R4年度卒研生(3年生)の研究室配属:濱島亨多君、檜谷晃一君、小林晨司君、期待してます!

12月

12/01~12/03 第44回日本分子生物学会年会(12月1〜3日)で岡田さん、有村さん、馬締君、木佐貫君、伊達君、宮川さんが発表します!オフライン(パシフィコ横浜)とオンラインのハイブリッド形式での開催です!

・岡田咲耶
演題名:大型膜べシクルによる細胞膜リモデリングと細胞機能の拡張と強化
Manipulation of cellular structure and enhancement of cellular function by the cell-derived giant membrane vesicles
ポスター番号:2P-0282
発表日:12月2日(木)
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【ワークショップ】
口頭発表セッション名:[1PW-03]エンハンスドバイオ
演題番号:1PW-03-8
日時:12月1日(水)15:45〜18:00
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・有村悠
演題名:多核巨細胞におけるミトコンドリアのダイナミクスと品質管理
Mitochondria dynamics and quality control in the multi-nucleated giant human cells
発表形式:ポスター発表
ポスター番号:2P-0258
発表日:12月2日(木)
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・馬締竜平
演題名:ヒト細胞を用いた細胞周期における脂肪滴の量的調節機序の解析
Quantitative control of the lipid droplets during cell cycle progression in the cultured human cells.
発表形式:ポスター発表
ポスター番号:1P-0260
発表日:12月1日(水)
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・木佐貫玲央
演題名:微小核へのインポーティンアルファの濃縮現象:核の構築と品質管理に関わる新機序の提案
Restricted targeting of importin to the subset of micronuclei, indicative of an unappreciated mechanism for nuclear assembly and quality control.
発表形式:ポスター発表
ポスター番号:1P-0216
発表日:12月1日(水)
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・伊達日向
演題名:S期停止時のヒト細胞サイズ変化と細胞老化をつなぐ分子回路の探索
Size regulation of cultured human cells arrested during S phase and its linkage to cellular senescence
【ポスター発表】
ポスター番号:1P-0299
発表日:12月1日(水)
【ワークショップ】
口頭発表セッション名:[1AW-12]細胞スケールでの空間サイズの制御とその意味の理解演題番号:1AW-12-2
日時:12月1日(水)09:00〜11:15
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・宮川玲花
演題名:ヒト細胞に対する光依存的クロロフィル毒性研究:盗葉緑体現象のヒト細胞での再現に向けて
Studies on photo-inducible cytotoxicity of plant chlorophylls in cultured human cells: Towards induction of kleptoplasty, a temporal symbiosis of chloroplast in animal cells, in human cells発表形式:ポスター発表
ポスター番号:2P-0345
発表日:12月2日(木)
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photo by H. Arimura

12/02 博士論文予備検討願いの提出:岡田
12/03 岡田さんの論文がJ. Biochem.誌にアクセプト!おめでとう!
12/06 9:30AM~ meeting at C204/216+掃除
12/07 2限学会報告会:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、宮川:渡部、小川、濱島、檜谷、小林art C204/216
12/08 3限M1プロゼミ予行 at C216渡部、木佐貫、伊達:岡田、有村、磯部、小川、山ア、宮川、濱島、檜谷
12/09 JC#7 山ア:岡田、有村、馬締、渡部、伊達、磯部、小川、東、濱島、小林、檜谷 A.J. Lomakin et al. The nucleus acts as a ruler tailoring cell responses to spatial constraints. Science 370, 6514 (2020)

12/11 プロゼミ発表(M1)at D201+Zoom online:木佐貫、伊達、渡部
12/13 9:30AM~ meeting at C204/216+掃除:岡田、有村、馬締、伊達、木佐貫、磯部、小川、山ア、宮川、濱島、小林、檜谷、東
12/16 JC#8 磯部:岡田、有村、馬締、伊達、木佐貫、渡部、小川、山ア、宮川、濱島、小林、檜谷、東
M. Tigano et al. Nuclear sensing of breaks in mitochondrial DNA enhances immune surveillance. Nature 591, 477-481 (2021)
12/20 9:30AM~ meeting at C204/216+掃除+木佐貫さん発表予行:岡田、有村、馬締、伊達、木佐貫、渡部、磯部、小川、山ア、宮川、濱島、小林、檜谷、東
12/21-22 第39回 染色体ワークショップ・ 第19回 核ダイナミクス研究会:木佐貫さん口頭発表「インポーティンαの微小核への分子濃縮現象:染色体不安定性とゲノム進化へのインポーティンαの寄与を考える」
12/22 博士論文予備検討結果報告書の提出締め切り
12/22 3~5限PR2:岡田、馬締、伊達、濱島、小林、檜谷、東:有村、木佐貫小川、山ア、宮川
12/23 JC#9伊達:岡田、有村、馬締、木佐貫、渡部、小川、山ア、宮川、濱島、小林、檜谷、東
M. D’Ario et al. Cell size controlled in plants using DNA content as an internal scale. Science 372, 1176-1181 (2021)
クリスマスパーティー(忘年会+3年生歓迎会)
岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、小川、山ア、宮川、濱島、小林、檜谷、東
12/23 3~5限PR2:有村、木佐貫小川、山ア、宮川:岡田、馬締、伊達、濱島、小林、檜谷、東

2022年(令和4)1月

01/06 JC#10 宮川:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、小川、山ア、磯部、濱島、小林、檜谷 T.E. Miller et al. light-powered CO2 fixation in a chloroplast mimic with natural and synthetic parts. Science 368, 649-654 (2020)
01/06 藤崎宮初詣and Lunch at Spice AROMA (Indian Restaurant):濱島、小林、檜谷
01/11 2限meeting at C216+掃除:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、渡部、小川、山ア、磯部、濱島、小林、檜谷、宮川、東
01/15-16 大学入試共通テスト
01/17 9:30AM~ meeting at 216+掃除:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、小川、山ア、濱島、小林、檜谷、宮川、東
01/18 卒論&修論の研究室締め切り
01/18-24 卒論&修論の研究室内査読期間
01/21 3限 at C226大講義室:岡田さん博士論文発表会の研究室内予行

01/24 9:30AM~ meeting at 216+掃除:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、磯部、小川、山ア、濱島、小林、檜谷、東
01/24 4限 at C226:岡田さん博士論文発表会・最終審査会
01/27 3限〜PR2岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、渡部、磯部、小川、山ア、濱島、小林、檜谷、宮川、東
01/28~ 17:00(時間厳守)修士論文提出締め切り→副指導委員の査読開始
01/31 18:00~JRF発表会on-line 東さん発表
01/31 9:30AM~ meeting at 216+掃除:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、磯部、小川、山ア、濱島、小林、檜谷、東

2022年(令和4)2月

02/01 (火)午後5時卒論提出締め切り(〜5:00PM百武さん)
02/07 9:30AM~ meeting at 216+掃除:岡田、有村、馬締、木佐貫、伊達、磯部、小川、山ア、濱島、小林、檜谷
02/07~09 3年次院試の申請書受付
02/08,09, 10 卒研発表会
02/08 山ア・磯部・小川の発表日、終了後、お昼に「ご苦労さんお茶会」at C216
02/14 修論発表会 at D201
02/15 磯部さん、ベストプレゼンテーション賞受賞!おめでとう!
02/16 3年次学部からの大学院入試
02/20 9:30AM~ meeting at 216+掃除:岡田、伊達、宮川、濱島、小林、檜谷
02/24 大学入学(前期)試験
02/28 9:30AM~ meeting at 216+掃除:岡田、木佐貫、伊達、宮川、濱島、小林、檜谷
02/28 3~4限PR2岡田、木佐貫、伊達、小川、宮川、濱島、小林、檜谷

2022年(令和4)3月

03/10 13~17:30PM 盗機能研究会Zoom

03/25 卒業式・修了式